六枝特區疾病預防控制中心成立於2002年10月26日,座落於特區建設南路,是具有獨立法人資格的正科級公益性衛生事業單位。中心以預防醫學理論和技術為手段,根據相應的法律、法規,面向全區開展急慢性傳染病、結核病、職業病、皮膚病(麻風病)、性病、愛滋病、慢性非傳染性疾病、寄生蟲病、地方病等疾病的預防控制及研究。承擔預防性體檢、健康監護及各類疾病實驗室診斷、衛生監測和健康相關產品的衛生質量檢驗及衛生學評價、以及疾病預防控制科研、培訓和健康教育及健康干預工作等。
六枝特區疾控中心設10個職能科室,現有職工34人,其中高級專業技術職稱2人、中級專業技術職稱9人、初級職稱20人、工勤及管理人員3人。擁有原子螢光、氣相色譜、分光光度計、自動酶聯免疫測定系統等檢測設備,建有二級生物安全實驗室、儀器分析室、理化檢驗室等先進實驗室。