《全國高等學校教材·生物信息學(供8年制及7年制臨床醫學等專業用)(附光碟)》是在國內資深生物學家與醫學專家的倡導下,經全國高等醫藥教材建設研究會、衛生部教材辦公室組織有關專家反覆論證後決定組織編寫的。由李霞主編,在教材的具體籌備和編寫過程中,全國高等醫藥教材建設研究會、衛生部教材辦公室先後組織三次會議進行研討。《生物信息學(附盤)》正是根據這些會議精神及專家的指導意見組織全國十餘所大學的一線教師和學者共同努力編寫而成的。《全國高等學校教材·生物信息學(供8年制及7年制臨床醫學等專業用)(附光碟)》共分為三篇十六章。第一篇生物信息學基礎;第二篇功能基因組信息學;第三篇生物信息學與人類複雜疾病。
基本介紹
- 書名:全國高等學校教材•生物信息學
- 類型:科學與自然
- 出版日期:2010年8月1日
- 語種:簡體中文
- ISBN:9787117129381, 7117129387
- 作者:李霞 李亦學
- 出版社:人民衛出版社
- 頁數:487頁
- 開本:16
- 品牌:人民衛生出版社
內容簡介,圖書目錄,
內容簡介
《全國高等學校教材·生物信息學(供8年制及7年制臨床醫學等專業用)(附光碟)》由人民衛生出版社出版。
圖書目錄
緒論
第一節 生物信息學的興起
一、人類基因組計畫
二、生物信息學與組學
第二節 生物信息學在生命科學中的地位及意義
一、生物信息學內涵
二、生物信息學在現代生物醫學發展中起著重要作用
第一篇 生物信息學基礎
第一章 DNA、RNA和蛋白質序列信息姿源
第一節 引言
第二節 核酸序列資料庫
一、GenBank資料庫
二、EMBL資料庫
三、DDBJ資料庫
四、其他資料庫
第三節 蛋白質序列資料庫
一、PIR資料庫
二、MIPS資料庫
三、其他資料庫
第四節 NCBI與EMBL-EBI
一、NCBI簡介
二、EMBL-EBI簡介
三、通過Entrez Gerle從NCBI獲取序列信息
四、通過SRS從EBI中獲取蛋白質序列信息
小結
第二章 雙序列比對
第一節 引言
一、同源、相似與相同
二、相似性的定量描述
三、空格
第二節 替換記分矩陣
一、通過點矩陣對序列比較進行記分
二、DNA序列比對的替換計分矩陣
三、蛋白質序列比對的替換記分矩陣
第三節 雙序列比對算法
一、全局比對的經典算法
二、局部比對的經典算法
第四節 資料庫搜尋
一、BLAST
二、資料庫搜尋實例
第五節 比對的統計學顯著性
一、全局比對的統計學顯著性
二、資料庫搜尋的統計學顯著性
第六節 參數的選擇
一、空格罰分參數
二、BLAST的參數
三、如何處理太多與太少的資料庫搜尋返回
小結
……
第三章 多序列比對
第四章 序列特徵分析
第五章 分子進化分析
第六章 表達序列分析
第七章 基因晶片數據分析
第二篇 功能基因組信息學
第八章 基因注釋與功能分類
第九章 蛋白質分析與蛋白質組學
第十章 蛋白質結構分析
第十一章 轉錄調控的信息學分析
第十二章 生物分子網路
第十三章 計算表觀遺傳學
第三篇 生物信息學與人類複雜疾病
第十四章 人類複雜疾病與計算機系統生物學
第十五章 單核苷酸多態與人類疾病
第十六章 miRNA與複雜疾病
中英文對照索引
英中文對照索引
附錄 藥物生物信息學
第一節 生物信息學的興起
一、人類基因組計畫
二、生物信息學與組學
第二節 生物信息學在生命科學中的地位及意義
一、生物信息學內涵
二、生物信息學在現代生物醫學發展中起著重要作用
第一篇 生物信息學基礎
第一章 DNA、RNA和蛋白質序列信息姿源
第一節 引言
第二節 核酸序列資料庫
一、GenBank資料庫
二、EMBL資料庫
三、DDBJ資料庫
四、其他資料庫
第三節 蛋白質序列資料庫
一、PIR資料庫
二、MIPS資料庫
三、其他資料庫
第四節 NCBI與EMBL-EBI
一、NCBI簡介
二、EMBL-EBI簡介
三、通過Entrez Gerle從NCBI獲取序列信息
四、通過SRS從EBI中獲取蛋白質序列信息
小結
第二章 雙序列比對
第一節 引言
一、同源、相似與相同
二、相似性的定量描述
三、空格
第二節 替換記分矩陣
一、通過點矩陣對序列比較進行記分
二、DNA序列比對的替換計分矩陣
三、蛋白質序列比對的替換記分矩陣
第三節 雙序列比對算法
一、全局比對的經典算法
二、局部比對的經典算法
第四節 資料庫搜尋
一、BLAST
二、資料庫搜尋實例
第五節 比對的統計學顯著性
一、全局比對的統計學顯著性
二、資料庫搜尋的統計學顯著性
第六節 參數的選擇
一、空格罰分參數
二、BLAST的參數
三、如何處理太多與太少的資料庫搜尋返回
小結
……
第三章 多序列比對
第四章 序列特徵分析
第五章 分子進化分析
第六章 表達序列分析
第七章 基因晶片數據分析
第二篇 功能基因組信息學
第八章 基因注釋與功能分類
第九章 蛋白質分析與蛋白質組學
第十章 蛋白質結構分析
第十一章 轉錄調控的信息學分析
第十二章 生物分子網路
第十三章 計算表觀遺傳學
第三篇 生物信息學與人類複雜疾病
第十四章 人類複雜疾病與計算機系統生物學
第十五章 單核苷酸多態與人類疾病
第十六章 miRNA與複雜疾病
中英文對照索引
英中文對照索引
附錄 藥物生物信息學