全國聯行往來對帳方法是指全國聯行往來的對帳程式及基本作法。由於我國的全國聯行往來基本上是各銀行自成體系，因此，對帳方法也不盡一致。綜觀各家銀行的全國聯行往來的對帳方法，大致可分為兩種：直接往來，集中監督，分散逐筆對帳方式。其基本作法是，發報行發生業務後，填制三聯報單，以第一聯報單寄送（電劃的以電報通知）收報行，向電子中心寄送往帳報告表（附報單第二聯），第三聯由發報行留存代聯行往帳科目卡片。
電子計算中心編制對帳表（逐筆填列），寄收報行逐筆對帳。年終未達査清，上劃結平。目前，中國人民銀行、中國工商銀行、中國農業銀行、中國人民建設銀行採用此種對帳方法。直接往來，直接對帳與定期對帳相結合的對帳方式。往帳行發生業務，填制兩聯聯行報單，以第—聯報單寄送（電劃的以電報通知）來帳行。第二聯往帳行留存代聯行往帳記帳憑證。聯行報單除簽發日期，往、來行行名及行號，本次收付發生額外，還有以來帳行為單位編列的報單順序號及餘額。來帳行除按規定審査報單外，還應審査順序號是否銜接，發生額與餘額是否正確（即直接對帳），無誤據以轉帳。每年6月、10月、12月末設定3次定期對帳，年度査清後淸算資金。目前，中國人民建設銀行採用此種對帳方法。
