全國日本經濟學會經民政部批准，於1978年8月19日正式成立。全國日本經濟學會由全國從事日本經濟研究、教學、新聞出版及對日經濟工作實務部門等有關各方面的人士自願結合組成，是非營利性的研究日本經濟和中日經濟關係的的民間學術團體。全國日本經濟學會現有會員（含團體會員）近千人，分布於全國各地。
全國日本經濟學會接受業務主管單位中國社會科學院和民政部的業務指導和監督管理，掛靠在中國社會科學院日本研究所。
全國日本經濟學會的宗旨是廣泛團結我國關心和從事日本經濟和中日經濟關係研究的學者及其他有關人士，推動我國日本經濟及其相關問題的研究，增進與日本有關團體和人士的學術交流和友好往來。成為向我國介紹日本經濟和向日本介紹中國經濟的視窗，成為促進中日友好和中日經貿關係健康發展的橋樑。
馬洪、孫尚清、孫漢超、羅元錚、沈覺人等我國著名經濟學家曾長期擔任學會的主要領導職務。現任會長為中國社會科學院前常務副院長、顧問、著名經濟學家王洛林教授。
全國日本經濟學會設理事會和常務理事會，學會的最高權力機構是會員代表大會。理事會是會員代表大會的執行機構，在其閉會期間領導本學會開展日常工作，對會員代表大會負責。學會的日常工作機構設有秘書處、學術部、聯絡部和編輯出版部。
全國日本經濟學會的業務範圍包括：
（一）舉辦全國性和地方性學術活動；
（二）組織國際學術交流活動；
（三）協調會員單位的有關研究工作；
（四）組織會員編輯、翻譯、撰寫日本經濟研究成果和有重要價值的學術材料；
（五）為社會提供有關諮詢服務；
（六）為社會培養有關專業人才服務。
全國日本經濟學會成立以來，先後舉辦了多次有較大影響的國際、國內學術會議，接待了許多日本學者和企業界人士來訪，並多次組團出訪日本，促進了中日學術界的交流和民間友好往來，產生了積極影響。
全國日本經濟學會的會刊是《現代日本經濟》，雙月刊，每年出版6期。編輯部設在吉林大學。同時,每年出版研究年刊《日本經濟藍皮書》。
