內蒙古自治區環境監測中心站為自治區環境保護廳所屬的正處級事業單位。其主要職責任務是：對全區環境空氣、水、土壤、噪聲、輻射和生態等環境要素進行環境監測和預警監測；對環境排放污染物或者對環境產生不良影響的場所、設施、裝置以及其他污染髮生源依法定期進行監督性監測；對自治區環境保護主管部門審批的建設項目進行竣工環境保護驗收監測和環境影響後評估監測；對盟市和自治區各行業實施環境保護工作進行環境質量監督監測；對國家和自治區環境保護主管部門建立的專項監測網、履行國際公約、協定以及國際合作項目開展專項環境監測；對轄區內影響較大或跨地區環境污染和生態破壞等環境事件進行應急環境監測和環境糾紛仲裁監測以及環境風險污染損害鑑定評估監測；編制全區環境質量監測報告、污染源監測報告、環境預警監測報告、突發環境事件應急監測報告和各類專項監測報告；對下級環境監測站進行業務和技術指導，組織監測技術的交流、培訓及考核；開展環境監測領域的國際合作和交流。
