免疫共沉澱法是以抗體和抗原之間的專一性作用為基礎的用於研究蛋白質相互作用的經典方法。是確定兩種蛋白質在完整細胞內生理性相互作用的有效方法。當細胞在非變性條件下被裂解時，完整細胞記憶體在的許多蛋白質-蛋白質間的相互作用被保留了下來。當用預先固化在argarose beads上的蛋白質A的抗體免疫沉澱A蛋白，那么與A蛋白在體內結合的蛋白質B也能一起沉澱下來。
（1）轉染後24-48 h 可收穫細胞，加入適量細胞裂解緩衝液含蛋白酶抑制劑冰上裂解30min, 細胞裂解液於4°C， 最大轉速離心30 min後取上清（2）取少量裂解液以備Western blot分析，剩餘裂解液加1μg相應的抗體加入到細胞裂解液，4°C緩慢搖晃孵育過夜（3）取10μlproteinA瓊脂糖珠，用適量裂解緩衝液洗3次，每次3,000 rpm離心3min；（4）將預處理過的10μlproteinA瓊脂糖珠加入到和抗體孵育過夜的細胞裂解液中4°C緩慢搖晃孵育2-4h，使抗體與proteinA瓊脂糖珠偶連；
