中華人民共和國阜新海關隸屬於中華人民共和國瀋陽海關。主要承擔阜新市及其下轄縣區的進出口通關、屬地監管、檢驗檢疫、保稅監管場所及海關特殊監管區域管理、稅收征管、業務統計及轄區內企業管理、後續監管等屬地管理職責。負責黨的基層組織建設和幹部隊伍建設。完成直屬海關交辦的其他工作。