中央銀行總行職能機構設定是中央銀行總行內部職能機構的設定情況。大多數國家的中央銀行總行都設有行政辦公機構，業務操作機構，金融管理機構，經濟、金融調研機構等四大類： ①行政辦公機構是中央銀行運作的綜合性的非業務部門，負責日常行政管理、秘書人事等方面的工作。②業務操作機構是中央銀行執行貨幣政策和有關業務活動的機構，主要負責貨幣發行、再貼現、對商業銀行貸款、收管存款準備金、集中清算、發行債券等業務。
③金融管理監督機構是中央銀行擔負金融行政管理的機構，負責對金融機構的管理、檢查、業務經營的監督和金融市場的管理。④經濟金融調查研究機構是中央銀行的情報、政策、諮詢機構，負責有關經濟金融資料和情報的收集、整理、統計、分析，對國民經濟和社會發展動態進行調查與總體研究，向決策部門提出建議，同時對其他金融機構和經濟部門提供信息和諮詢服務。中央銀行總行內部機構由於各國情況千差萬別，名稱不一，但有兩點基本是一致的，一是總行一級內部機構的設定較多，分工較細，掌管著中央銀行的主要活動，因而工作人員占全行系統的比重較大; 二是普遍重視調查、政策分析、經濟和金融研究，因而在內部結構中，調研分析部門在整個機構中占有重要地位。
