抗日戰爭時期,中央軍委在新四軍中建立的派出領導機構,也是新四軍最高決策機構。1937年12月,根據中共中央政治局會議決定,在組建新四軍軍部的同時,由項英、陳毅、張鼎丞、曾山、黃道五人組成中央革命軍事委員會新四軍分委員會(簡稱新四軍軍分會)。項英任主席,陳毅任副主席。不久,項英根據新四軍由南方八省14個地區紅軍游擊隊組建而成的實際情況,提出新四軍軍分會由項英、陳毅、周子昆、傅秋濤、張鼎丞、劉英、高敬亭、譚余保、曾山九人組成,項英、陳毅、周子昆為常委,項英任書記,陳毅任副書記。1940年秋,增補饒漱石為委員。皖南事變以後,中央重建新四軍軍分會(又稱中央軍委華中分委員會),由劉少奇、陳毅、張雲逸、鄧子恢、賴傳珠組成,劉少奇任書記。1942年3月,劉少奇回中央工作,陳毅代理軍分會書記。1945年2月,中共中央決定撤銷新四軍軍分會,將中共中央華中局擴大為12人組成,以陳毅、饒漱石、張雲逸、曾山、賴傳珠五人為常委,直接實施對新四軍的領導。同月,新四軍轉歸中央華中局領導。抗日戰爭結束後,中央軍委新四軍分委員會撤銷。