《中國多發性硬化HLA-II類易感基因及SNP研究》是依託中山大學,由邱偉擔任項目負責人的青年科學基金項目。
基本介紹
- 中文名:中國多發性硬化HLA-II類易感基因及SNP研究
- 項目類別:青年科學基金項目
- 項目負責人:邱偉
- 依託單位:中山大學
中文摘要,結題摘要,
中文摘要
目前國內外關於多發性硬化(MS)與HLA關聯性研究結果不一致,而對MS患者HLA區域單核苷酸多態性(SNP)研究甚少。為此,我們對中國MS患者HLA-II類基因及其SNP進行關聯研究,以期達到以下目的:(1)探索MS患者HLA-II類區域新的易感基因及其相互作用;(2)篩選並確定與MS關聯的HLA-II類區域SNP位點,建立一種立足於標籤SNP(TaqSNP)的MS基因分析方法。 我們運用PCR-SBT法對400例中國漢族MS患者及健康對照行HLA-II類基因分型,採用病例-對照及傳遞不平衡的策率進行關聯分析;之後,基於HapMap資料庫篩選TaqSNP,運用TaqMan技術對其中200例MS及對照進行SNP基因分型及關聯分析,得出MS關聯的SNP。最後,在另200例MS及對照中驗證上述TaqSNP,分析TaqSNP在MS易感基因檢查中的敏感性、特異性,及與HLA分型的相關性。
結題摘要
多發性硬化(MS)是一種免疫相關性中樞神經系統脫髓鞘疾病,臨床表現異質。MS的亞型-視神經脊髓炎(NMO),也稱為視神經脊髓型MS(OSMS)在國人較傳統型MS發病率更高。研究MS易感基因,對MS高危人群預報、早期干預與預防及發病機制的理論研究有重要意義。本課題第一部分探討NMO患者AQP4基因多態性與疾病易患性之間的相關性。通過收集2010年1月-2014年1月在中山大學附屬第三醫院神經科就診的84例NMO患者作為研究對象,PCR擴增AQP4基因功能區,再通過與單核苷酸多態性資料庫公布的中國人群AQP4基因DNA序列比較。結果共發現9個未報導的新變異位點,1個變異位於外顯子2區,其餘8個變異均位於基因調控區。AQP4基因功能區SNP rs3763043及rs14393,與dbSNP數據比較突變頻率差異具有統計學意義。因此,我們的研究結果初步表明:(1)AQP4基因SNP與多數漢族NMO患者發病無明顯相關性,但少數患者存在AQP4基因多態性改變;(2)東、西方NMO患者AQP4易患基因多態性位點不同。 本課題第二部分探討探討AQP4基因多態性與國人NMO臨床表型的遺傳相關性及分子機制。通過收集111例 NMO患者及97例NMO譜系疾病患者和204例健康對照作為研究對象,選擇AQP4基因調控區的8個SNP進行基因分型,之後通過關聯分析SNP基因基因型與NMO臨床表型的相關性,最後利用雙螢光素酶檢測技術驗證3'-非翻譯區(3'-UTR)SNP位點的鹼基改變對小分子RNA(miRNA)調控作用的影響。結果發現miRNA 323-3p對AQP4基因表達有調控作用,但3’-UTR區rs1058424鹼基改變並不影響miRNA 323-3p對AQP4基因的調控。因此,AQP4基因非編碼區可以對AQP4 mRNA的穩定性等進行轉錄後調控,進而影響AQP4的表達量以及OAP結構形成,最終影響NMO中AQP4的抗原性。因此本課題研究表明,AQP4基因3’-UTR區的基因多態性與NMO臨床表型具有相關性。miRNA 323-3p可能通過與AQP4基因3’-UTR區某一特定位點結合起調節作用,從而參與NMO發病。本研究為開發作用於AQP4基因3’-UTR區的NMO藥物治療奠定基礎。