中國古生物學專業資料庫

本系統是我們根據古生物學學科的特點,經過廣泛調研後建立的古生物學專業資料庫。這一系統切合了古生物學與相關學科的國際前沿和熱點研究,並綜合考慮了未來的長期發展需要。數據的來源主要是過去100 多年裡發表的關於中國化石記錄的文獻資料,我們按照一定的標準規範將各類數據資源信息化,並經過學科專家的加工,以提高其科學價值。在數據內容上,以中國華南、塔里木和華北這三個中國最大的古板塊、也是中國油氣勘探的三個主要地區的化石記錄和相關條目為主,時代上重點選擇古生代這一與中國油氣的“生儲蓋”(生成、儲藏和蓋層)密切相關的時期;涵蓋了相關的文獻數據、化石分類信息數據(Taxonomy)和化石產出記錄數據(Collection),以及相關的剖面數據如地理位置、岩石信息等。在過去的兩年里,數據條目基本保持每天持續更新,累計新添數據條目6 萬多條。這些數據基本涵蓋了古生物學科學研究所必需的數據信息,與現有的國際同類資料庫相比,所涉及的內容和涵蓋的學科領域均達到了國際前沿水平,可以充分滿足古生物學研究近期和未來的研究需求。

基本介紹

  • 中文名:中國古生物學專業資料庫
  • 類型:系統
  • 研究:生物學
  • 方式:提供文字查詢方式
內容簡介,使用方法,套用案例,持續發展,

內容簡介

由於本項目直接面向科研服務,因此,結合相關的熱點科研套用,以及古生物學的數據特點,由科學家參與制定了一系列相關的數據質量控制和關係措施,通過這些措施,可以大大提高數據質量與科學價值,並提升資料庫對科學家的吸引力。具體措施包括:對建庫人員分級,不同級別的用戶擁有不同的許可權,由學科專家對數據質量負責;從科學家的需求出發,根據古生物學的數據特點,儘可能依據國際標準確立相應的數據標準,確定相關欄位;建立數據厘定機制,由相關的學科專家負責對每一數據條目的厘定和加工,從而提升數據的科學價值,以利於科學研究。此外,針對古生物學研究的不同主題,採用WEB SERVICES 技術,集成和開發了一系列服務於古生物學科學研究和生產套用的數據挖掘、可視化和處理分析的網路服務工具,包括地理可視化與分析工具GeoVisual 的開發,地層信息可視化工具TimeScale Creator(美國Purdue 大學Ogg 教授等開發)的集成、定量地層對比軟體CONOP 9(美國加州大學Sadler 教授開發)的集成等。
資料庫現提供線上共享服務,共享方式為分級共享。這一分級共享體系是我們對國內外的學者進行了較為詳細和廣泛的調研後,建立的符合用戶需求以及資料庫發展要求的體系。概括來說,所有的數據分為兩類,一類是全公開數據,一類是數據擁有者(數據集成者)可設定共享許可權的數據。前者如文獻信息、分類信息等常用信息,後者如化石的具體產出層位、專家的附加厘定信息等。對於第二類數據,數據的擁有者可根據用戶的許可權以及貢獻度的不同等,決定數據的共享許可權,如完全公開、工作組內共享、研究組內共享、個人私有等。資料庫本身為科學家提供免費服務,不收取任何費用。
由於資料庫面向國內外的用戶,因此我們提供7×24 小時的線上服務,並保證99% 以上的網路聯通率。

使用方法

本系統目前針對三個大的數據子集均提供文字查詢方式,包括文獻搜尋,分類信息搜尋,以及化石產出記錄搜尋。其中化石產出記錄是最重要的搜尋功能,用戶可藉此查詢詳細的化石記錄,包括產地信息(國家、省、市、縣、村、剖麵點)、經緯度數據、地層信息(如岩石地層、生物地層、年代地層等)、共生化石信息等。用戶可將搜尋的結果存入自己的線上數據目錄中。當用戶通過一系列的搜尋,並將結果存入線上數據目錄中,最終將可生成其專屬的數據子集。例如,用戶想要研究華南五峰組海相烴源岩的時空分布,可通過一系列的搜尋,最終生成一個由100 多個剖面組成的數據子集,然後利用系統中集成的數據可視化和分析工具進行科學分析,例如,利用GeoVisual 查看剖面的分布情況;利用TS Creator 查看單個剖面的岩石地層和生物地層信息,或者多個剖面間的對比;利用CONOP 進行地層的自動複合和生成多樣性曲線等。用戶也可選擇將數據以表格形式下載至本地硬碟,自行分析。

套用案例

本系統自上線以來,已經配合973 項目、國家自然科學重點基金和面上項目、中科院創新方向性項目等提供了一系列數據服務。例如:
1. 華南奧陶- 志留紀黑色烴源岩的時空分布分析。此項研究的主要目的是配合中國油氣勘探的需要,進行中國與油氣相關的重要地層的普查工作。資料庫方面與之配套的一個工作就是建立相應的五峰組和龍馬溪組黑色頁岩的分布資料庫,並利用線上可視化和地理分析工具GeoVisual 分析南方奧陶- 志留系的兩套重要烴源岩的時空分布模式。
2. 華南二疊紀生物多樣性研究。根據973 項目的需要,我們配合科學家收集、整理、集成了華南二疊紀的數十條剖面數據,建立資料庫,並利用集成的CONOP 功能進行剖面生物地層信息的綜合與多樣性分析。

持續發展

中國古生物學專業資料庫現在是中科院南京地質古生物研究所和現代古生物學與地層學國家重點實驗室的重要發展方向之一,因此得到了相關部分的大力支持以及長遠支持。資料庫的用戶既包括國內學者,也包括了部分國外用戶。通過這一資料庫,一些廣泛的國際合作已經在開展之中,涉及古生物地理、古生物多樣性、地層的洲際對比等。迄今為止,資料庫中集成的數據以中國數據為主,但很快將轉向國際。
中國古生物學專業資料庫

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