上海日本研究交流中心成立於2009年12月，是由上海市編制辦批准、上海市財政全額撥款，隸屬於上海市人民對外友好協會的事業單位。
中心宗旨是以中日關係為主線，對涉及兩國政治、經濟、外交、社會、文化等領域的問題進行自主研究與委託研究，提出對日工作的綜合政策建議；組織、參與中日之間民間友好交流活動，促進兩國民間相互理解，推動兩國民間友好往來。
主要業務為從事和扶植日本問題研究，開展中日友好交流活動，業務範圍主要是日本問題的研究、交流和諮詢服務等，包括：
l組織對涉日問題的調查和研究；
開展多種形式的學術交流活動；
為上海市人民政府領導層的相關決策提供諮詢服務；
為上海與日本各界開展互利互惠的友好交往拓展渠道；
接受有關部門和企事業單位的委託，進行課題研究、專業培訓，並向社會開放提供有關涉外特別是日本問題的專題諮詢和服務。
中心現有人員11名，與上海市及全國對日研究權威機構均有密切的合作關係。
中心設立學術委員會，作為學術研究與活動的指導機構，中心學術委員會共有成員26人，包括上海及全國對日研究著名專家學者，全面開展涉日政治、經濟、外交、社會、文化等領域的研究和交流。
中心定期舉行學術研討會，邀請上海市及全國日本問題研究學者、日本相關領域專家，圍繞中日之間的焦點、難點、熱點問題開展學術研討；協調組織各類學術交流活動；組織有志從事對日研究的青年學者、學生舉辦沙龍；開展中日民間文化交流，參與舉辦各類民間友好活動，促進中日文化互鑒，加深了解和友誼。
