volcano plot

volcano plot(火山圖),在一張圖中顯示了兩個重要的指標(Fold change/p-Value),可以非常直觀且合理地篩選出在兩樣本間發生差異表達的基因。

利用T檢驗分析出兩樣本間顯著差異表達的基因後,以log2(fold change)為橫坐標,以T檢驗顯著性檢驗P值的負對數-log10(P-value)為縱坐標,即可得火山圖(Volcano Plot),利用一定的篩選條件(如大於1.5倍變化且P<0.05),可以篩選出顯著差異表達的基因,進行後續研究。
目前認為,由火山圖篩選差異表達基因,其結果更合理,更可靠。

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