mirbase資料庫，數據管理不再僅僅是存儲和管理數據，而轉變成用戶所需要的各種數據管理的方式。
基本介紹
- 中文名：mirbase
- 基本結構：分三個層次
- 數據種類：3種
2014年6月26日，Sanger microRNA 序列資料庫（miRBase）升級至 21.0 版本。新版本miRNA資料庫升級距上一次資料庫的更新(mirRNA20.0 2013年6月25日發布)經歷了一年的時間。新的miRBase21.0資料庫中，人、大鼠和小鼠的變化不大；人多了3個成熟的miRNA；小鼠多了9個成熟的miRNA；大鼠多了38個成熟的 miRNA。但是，其它物種（蝙蝠，馬，羊，眼鏡蛇和三文魚等物種）有了較大的更新。總計，新增了4196條髮夾前體序列和5441條成熟miRNA。
2012年8月1日正式發布了。相比於以往版本的資料庫，19.0版資料庫進行了巨大的數據更新：miRNA髮夾前體序列已升至21264條，新增3171條；成熟miRNA升至25141條，新增3625條；已發布的miRNA序列共涵蓋193個物種，相比於18.0版新增25個物種。新版資料庫對miRNA序列注釋和命名進行了系統的修正，miR*命名已經終止使用，取而代之的是-5p和-3p的命名法。新增成熟體miRNA在動物中最具代表性的有Homo sapiens [人]新增121條，Mus musculus [小鼠]新增124條，Gallus gallus [雞]新增247條，Bos taurus [牛]新增79條。植物中增長最為顯著的是Malus domestica [蘋果]新增205條，Glycine max [大豆]新增160條，Populus trichocarpa [毛果楊]新增132條，Cucumis melo [甜瓜]新增117條，Oryza sativa [水稻]新增47條。第一次發布了Nicotiana tabacum [菸草] 165條成熟體miRNA。
2011年11月4日（台北時間），Sanger microRNA序列資料庫(miRBase)升級至18.0版。在新版本中，髮夾前體序列升至18226條，新增1488條；成熟miR和miR*產物共21643條，新增1929條；新版本報導序列共涵蓋個168個物種。
miRBase序列資料庫是一個提供包括miRNA序列數據、注釋、預測基因靶標等信息的全方位資料庫，是存儲miRNA信息最主要的公共資料庫之一。miRBase提供便捷的網上查詢服務，允許用戶使用關鍵字或序列線上搜尋已知的miRNA和靶標信息，詳情請訪問。
2011年11月4日（台北時間），Sanger microRNA序列資料庫(miRBase)升級至18.0版。在新版本中，髮夾前體序列升至18226條，新增1488條；成熟miR和miR*產物共21643條，新增1929條；新版本報導序列共涵蓋個168個物種。從之前的版本（17.0）開始，miRBase一直致力於對成熟序列進行重命名，用-5p/-3p命名法取代miR/miR*命名法。本次更新過程中大約對將近1400條成熟序列進行了重命名，涵蓋人、小鼠和線蟲3個物種。斑馬魚互補miRNA（miRNA complement）發生了很大的變化，依據Zv9基因組拼裝對收錄序列進行了合理的調整，刪除了26條斑馬魚序列，並新增了12條代表重複基因位點的序列。新增miRNA序列動物中最具代表性的有Homo sapiens [人]新增103條，Mus musculus [小鼠]新增21條，Oryzias latipes [青鱂]新增152條。植物物種中增長最為顯著的是Medicago truncatula [蒺藜苜蓿]新增260條，Glycine max [大豆]新增159條，Oryza sativa [水稻]新增90條，Arabidopsis thaliana [擬南芥]新增59條。
此外 ，新版本中首次收錄的物種共有15個。 囊泡藻界：Phaeodactylum tricornutum [三角褐指藻] (13)
7個動物物種： Anolis carolinensis [綠安祿蜥] (282)， Macropus eugenii [尤金袋鼠] (2)，Sarcophilus harrisii [袋獾] (67)，Rhipicephalus microplus [微小扇頭蜱] (24)，Ascaris suum [豬蛔蟲] (97)，Glottidia pyramidata (1)，Terebratulina retusa (1)。 6個植物物種：Cucumis melo [甜瓜](3)，Acacia auriculiformis [大葉相思] (7)，Acacia mangium [馬占相思] (3)，Salvia sclarea [熏衣蘇草] (18)，Bruguiera cylindrica [柱果木欖] (4)，Bruguiera gymnorhiza [木欖] (4)。
病毒：Herpesvirus saimiri strain A11 (3)。
