microRNA功能相似度度量的生物信息學方法研究

《microRNA功能相似度度量的生物信息學方法研究》是張其鵬為項目負責人，北京大學為依託單位的青年科學基金項目。

基本介紹

• 中文名：microRNA功能相似度度量的生物信息學方法研究
• 項目類別 ：青年科學基金項目
• 依託單位 ：北京大學
• 項目負責人：張其鵬

結題摘要

在本自然科學基金青年項目的資助下，本人系統研究了基於microRNA（miRNA）和人類疾病關聯數據的miRNA功能相似度度量的生物信息學方法，並實現了相應算法。系統研究人類基因間長鏈非編碼RNA（lncRNA）上單核苷酸多態性（SNP）。構建了國際上第一個長鏈非編碼RNA疾病資料庫（lncRNADisease），並開發了一個基於lncRNA基因組位置的lncRNA相關疾病預測生物信息學方法。受本基金資助，本人發表SCI論文2篇，本人所在課題組發表SCI論文1篇。

項目摘要

通過生物信息學方法度量microRNA（miRNA）之間的功能相似度可以快速預測miRNA的功能和可能參與的疾病，是快速認識miRNA的重要研究手段。但是，因為大多數miRNA的功能未知，因此，目前還沒有專門的生物信息學方法用於該目的。我們整理注釋了大量的miRNA和疾病關聯數據，並研究發現miRNA的功能和其所參與的疾病具有密切關聯，並且疾病之間的關係可以用樹狀結構定量描述。根據以上觀察，我們提出基於miRNA和疾病關聯數據的miRNA功能相似度生物信息學度量方法，旨在通過度量miRNA所關聯疾病的相似度來度量miRNA的功能相似度。該項目的完成將不僅很大程度上解決miRNA功能相似度的生物信息學度量這一科學問題，而且為快速注釋miRNA功能、預測miRNA相關疾病、鑑定新的疾病生物標記物提供了一種新方法。因此，本項目的完成既具有一定的理論意義，又具有實際的套用價值。