labelfree

是國際上最流行的一種蛋白質組學分析方法。用於分析不同組織或細胞之間的蛋白相對差異。

基本介紹

• 中文名：非標定量法
• 外文名：labelfree

非標定量法(Labelfree)是近年來重要的質譜定量方法，通過比較質譜分析次數或質譜峰強度，分析不同來源樣品蛋白的數量變化。該技術無需昂貴的同位素標籤做內標，提高了低豐度蛋白質的檢測效率和蛋白質定量的準確性，廣受科研工作者的推崇。

非標定量法( Label-free) 是通過比較質譜分析次數或質譜峰強度，分析不同來源樣品蛋白的數量變化，認為肽段在質譜中被捕獲檢測的頻率與其在混合物中的豐度成正相關， 因此蛋白 質被質譜檢測的計數反映了蛋白質的豐度，通過適當的數學公式可以將質譜檢測計數與蛋白質的量聯繫起來,從而對蛋白質進行定量。按照其原理主要分為兩種，第一種spectrum counts類的非標記方法，發展比較早，已經形成多種定量算法，但是主要的原理都是以MS2的鑑定結果為定量基礎，各種方法的差別在於後期算法在大規模數據上的修正。第二種非標記定量的原理是以MS1為基礎，計算每個肽段的信號強度在LC-MS上的積分。

目前，已經有一系列配套的非標記定量分析軟體，其中包括的GE公司開發的DeCyder MSTM商業化軟體，領先的蛋白質組學定性定量算法MaxQuant。運用這些軟體，對液相色譜串聯質譜數據非標記定量分析是將質譜數據由譜峰形式轉化為直觀的類似雙向凝膠的圖譜，譜圖上每一個點代表一個肽段，而不是蛋白質；再比較的不同樣本上相應肽段的強度，從而對肽段對應的蛋白質進行相對定量。實踐證明其具有很好的定量準確性和可信性，現在已經逐漸成為蛋白質組學領域內的標準解決方案。