GAPDH或G3PDH是甘油醛-3-磷酸脫氫酶( glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase )的英文縮寫。GAPDH是糖酵解反應中的一個酶,廣泛分布於各種組織中的細胞。
基本介紹
- 中文名:甘油醛-3-磷酸脫氫酶
- 外文名: glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase
- 簡稱:GAPDH
- 性質:糖酵解反應中的一個酶
- 分子量:146 kDa
- 細胞分布:廣泛分布於各種組織中
- 套用:蛋白印跡法 內參
基本介紹,參數,
基本介紹
該酶是糖酵解反應中的一個酶,由4個30-40kDa的亞基組成,分子量146kDa。該酶基因為管家(house keeping)基因,幾乎在所有組織中都高水平表達,在同種細胞或者組織中的蛋白質表達量一般是恆定的,且不受含有的部分識別位點、佛波脂等的誘導物質的影響而保持恆定,故被廣泛用作抽提total RNA,poly(A)+ RNA,Western blot等實驗操作的標準化的內參。常用的內參有,ACTB(β-actin、β-肌動蛋白)、GAPDH或18S等。目的是在於避免RNA定量誤差、加樣誤差以及各PCR反應體系中擴增效率不均一、各孔間的溫差等所造成的誤差、這些都是管家基因,在各個組織中的表達量相對穩定,其中18S同整個基因譜有關(負責裝配),它在總RNA中占的比例最高。
轉染了GAPDH相關siRNA的HeLa細胞在轉染後48小時後不斷增殖。 紅:被標記的siRNA;藍:被染色的細胞核;綠色:GAPDH蛋白。
陰性對照(scrambled siRNA)的導入(左)對GAPDH蛋白的表達沒有影響,不過若轉入一個以GAPDH(右)為靶標的siRNA,則會導致GAPDH蛋白表達水平的急劇下降。
參數
GAPDH(甘油醛-3-磷酸脫氫酶)是參與糖酵解的一種關鍵酶,由4個30-40kDa的亞基組成,分子量146kDa,檢測條帶大約在36kDa。GAPDH基因幾乎在所有組織中都高水平表達,廣泛用作Western blot蛋白質標準化的內參。因為GAPDH 作為管家基因在同種細胞或者組織中的蛋白質表達量一般是恆定的,因此在使用GAPDH內參抗體時,將每個樣品測得的目的蛋白含量與本樣品的GAPDH含量相除,得到每個樣品目的蛋白的相對含量,然後才進行樣品與樣品之間的比較。