U平面協定棧是指U平面通過業務類型（ATM或GEM模式)和它們的Port-ID或VPI來識別業務流。Port-ID用來識別GEM業務流，VPI用來識別ATM業務流。GPON採用G.983.4中規範的傳輸容器（T-CONT）概念，T-CONT通過Allco-ID來識別，是捆綁業務單元。頻寬分配和QoS保障都以每個TCONT為單位授權控制，不同的業務類型不能映射到同一個T-CONT，必須被映射到不同的TCONT，每個TCONT有不同的Allo-ID。
U平面內的業務流用業務流類型(ATM、GEM)及其連線埠ID或VPI來標識。連線埠ID用於識別GEM業務流，VPI用於識別ATM業務流。在T-CONT(傳輸容器)中通過可變的時隙控制來實現寬頻分配和QoS控制。嵌入式OAM通道位於GTC幀的幀頭，使用此通道的主要功能包括：寬頻確認、交換、動態頻寬分配信令等。PLOAM通道是一個格式化的訊息系統，在GTC幀中占據專有空間，主要用於承載那些不通過嵌入式OAM傳送的PMD和GTC管理信息。OMCI通道用於管理業務。
