《TNF-α抑制劑治療銀屑病療效相關基因的篩選與功能研究》是依託浙江大學，由任韻清擔任項目負責人的面上項目。
基本介紹
- 中文名：TNF-α抑制劑治療銀屑病療效相關基因的篩選與功能研究
- 依託單位：浙江大學
- 項目負責人：任韻清
- 項目類別：面上項目
項目摘要,結題摘要,
項目摘要
銀屑病是一種常見的慢性炎症性皮膚病，由遺傳、免疫和環境等多因素共同作用所致。TNF-α抑制劑是一種治療銀屑病的有效生物製劑，但其療效及不良反應存在明顯的個體差異，且這種差異的機制不明確。因此，為闡明不同個體對藥物不同反應的機制，我們以TNF-α抑制劑治療的銀屑病患者為研究對象，通過轉錄組測序篩選出TNF-α抑制劑治療前後差異表達的關鍵基因；採用實時定量PCR、免疫組化、免疫印跡等方法在mRNA、蛋白質水平驗證。同時，結合靶向測序與基因分型的方法搜尋與治療反應相關的關鍵基因變異，並通過螢光素酶雙報告基因、RNA干擾等方法進行系列功能研究，鑑定出與療效密切相關的功能性基因變異，為中國人群銀屑病患者個體化治療提供理論指導。以篩選出的關鍵基因為靶標進一步構建轉基因小鼠模型，探討該基因在銀屑病發病中的作用，為發現新的相關基因與治療靶點奠定基礎。
結題摘要
銀屑病是一種常見的慢性炎症性皮膚病，由遺傳、免疫和環境等多因素共同作用所致。TNF-α抑制劑是一種治療銀屑病的有效生物製劑，但其療效及不良反應存在明顯的個體差異，且這種差異的機制不明確。目前關於其治療銀屑病的藥物遺傳學研究相對比較局限，研究樣本量較小，且存在地域和種族上的異質性。本研究收集了212例依那西普治療中國漢族斑塊型銀屑病患者，包括治療前後的外周血DNA、不同時間點RNA樣本及長期隨訪臨床資料，建立了一個較完整的生物製劑治療銀屑病的藥物反應個體化多樣性資料庫，深入開展了系列的藥物遺傳學研究。通過對212例接受依那西普治療的銀屑病患者進行全基因組SNP分型實驗，利用全基因組關聯分析研究這些基因的變異位點與TNF-α抑制劑治療銀屑病療效的相關性（有效組vs無效組）。結果發現在治療24周時，依那西普單藥治療組DCHS2基因rs117192735位點與治療反應呈明顯相關性(P=2.57E-07)；而在依那西普聯合甲氨蝶呤組，在治療24周時，發現rs7621900、rs78219077、rs71527245、rs72688609、rs13288811、rs139759817、rs149087125 7個位點與治療反應呈明顯相關性且達到全基因組顯著水平。通過對依那西普治療的銀屑病患者血樣（治療前vs治療12周）的轉錄組表達譜深入挖掘，將差異基因表達和共表達分析的整合，優先考慮具有相關功能的DEGs，最佳化了差異表達基因篩選的生物信息學分析方法，成功發現19個差異表達基因可能與依那西普治療反應相關。更進一步擴大樣本量，在34例接受依那西普治療的銀屑病患者不同時間點（治療前vs治療12周、24周）進行轉錄組差異表達研究，以期鑑定出與依那西普治療銀屑病療效相關的更多的功能性關鍵基因。這是首次在中國漢族銀屑病患者中展開較大規模的TNF-α抑制劑藥物遺傳學研究，研究結果對闡明療效個體差異的遺傳機制具有重要意義，為中國人群銀屑病患者個體化治療提供理論基礎。項目實施期間，在Sci Rep、BMC Syst Biol、Exp Dermatol、Indian J Dermatol Venereol Leprol發表4篇SCI論文，1篇中文核心期刊論文；協助培養博士生、碩士生各1名。
