RNA假結

RNA假結是一個長度為n的RNA序列R=r1r2…rn 的假, 結結構定義鹼基配對集合S={(ri,rj )}。

定義:RNA中的一種常見的三級結構元件。RNA的莖環結構中的環上序列與其他部位(通常是鄰近部位)的序列鹼基配對,形成類似“打結”形狀。

基本介紹

  • 中文名:RNA假結
  • 外文名:RNA pseudoknot
  • 長度:為n
  • 集合:ri,rj
  • 滿足:以下條件
一個長度為n的RNA序列R=r1r2…rn 的假
結結構定義鹼基配對集合S={(ri,rj )},其中
(ri,rj)滿足以下條件:
(1)(ri,rj)∈{(A,U),(U,A),(G,C),
(C,G),(G,U),(U,G)},1≤i
3;
(2)若(ri,rj)∈S,(rk,rg)∈S,則i =k當且
僅當j =g;
(3)愁(ri1,rj1),(ri2,rj2),…,(rip,rip)∈S,
(rk1,rg1),(rk2,rg2),…,(rkq,rgq)∈S,且ri1 <ri2 <
…<rip <rk1 <…<rkq,則有ri1 <ri2 <ri3 <…<rip
<rk1 <rk2 <…<rkq <rjp <rjp-1 <…rj1 <rgq <rgq-1
<…2或ri1 <ri2 <ri3 <…<rip <rj1 <
rj2 <rj3 <…2

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