《PTPN22基因與中國人群Graves'病的相關性研究》是依託上海交通大學，由潘春明擔任項目負責人的青年科學基金項目。
基本介紹
- 中文名：PTPN22基因與中國人群Graves'病的相關性研究
- 項目類別：青年科學基金項目
- 項目負責人：潘春明
- 依託單位：上海交通大學
項目摘要,結題摘要,
項目摘要
我們前期的研究發現，瀰漫性甲狀腺腫伴甲亢（Graves' disease，GD）存在不同的亞型，不同的亞型可能有不同的主效基因或同一個易感基因的不同SNP變異引起的，且這些發現已被一些研究者證實。但不同亞型由同一個易感基因上不同SNP位點導致的證據有一定的局限性，需要提供更多新的證據。已明確PTPN22上的SNP rs2476601是歐洲人群GD的致病易感位點，但該SNP在日本和中國人群中不存在，為我們驗證這種理論提供良好的模型。我們基於1536例病人和1516例正常人GWAS結果，通過Imputation分析，發現PTPN22區段有大量SNP位點和中國人GD發生相關，進一步，選擇PTPN22區段內tagSNPs，在大樣本人群中進行基因分型，通過生物信息學分析結合功能研究，明確PTPN22是否是中國人群GD的致病易感基因，並識別致病易感SNP位點，為我們提出的假說提供更可靠的證據。
結題摘要
該項目進展順利，取得了一些新的成果，並產生了重要的可繼續深入的研究的新的領域。目前的研究已經明確，PTPN22並非中國人群中GD的致病易感基因，由此進一步證實了我們提出的科學假說，即同一種多基因病可能有不同的亞型，不同的亞型可能由不同的主效基因，或者由同一易感基因不同的SNP位點變異引起的。結合前期GWAS篩查的結果，挑選了125個可能和GD的發生密切相關的SNP位點，進行了三階段全基因組關聯分析研究，識別了5個新的GD的致病易感位點；同時該研究還驗證了一個備受爭議的GD易感位點，即8q24.22的TG。同時，逃逸X染色體失活的位於Xq21.1上的ITM2A和女性GD 患者的相關性顯著強於於男性，以及14q31區段的致病易感基因TSHR兩個獨立的易感位點只與抗甲狀腺藥物治療一年以上的GD患者體內促甲狀腺激素受體抗體（TRAB）持續陽性相關，均支持甲亢存在分子亞型的假說。血清TSH水平的GWAS研究結果顯示8q12.1區段XKR4及9q22.33區段FOXE1基因多態性與中國人群血清TSH水平及PTC的易感性相關，且為血清TSH水平調節機制及低血清TSH水平與PTC易感性相關提供了新的見解。在該項目的部分資助下，已發表SCI收錄論文5篇。
