NYS7位點CMN新基因克隆與鑑定

《NYS7位點CMN新基因克隆與鑑定》是依託中山大學，由肖學珊擔任項目負責人的面上項目。

基本介紹

• 中文名：NYS7位點CMN新基因克隆與鑑定
• 項目類別：面上項目
• 項目負責人：肖學珊
• 依託單位：中山大學

中文摘要

先天性運動性眼球震顫（CMN）是一類單基因遺傳病，可能由控制眼球運動的腦部神經網路異常有關。在前一個基金的資助下，我們發現一個新的CMN基因位點NYS7。通過外顯子組和全基因組測序、比較基因組雜交，結果排除了NYS7區域全部已知基因，但在一個家系檢測到約0.9Mb缺失，缺失區域無已知功能基因，提示有一個尚待克隆的新致病基因。本項目擬以此為基礎來克隆該基因。首先以缺失區域內表達序列標籤等為線索，套用5'RACE和3'RACE技術從cDNA文庫克隆新基因全長cDNA。 然後通過與人類基因組比較確定該基因外顯子、內含子的相對位子和序列，結合生物信息分析預測該基因編碼的蛋白質序列。繼而分析另一個定位於此的家系及其它CMN家系中該基因的突變，初步確定新致病基因。最後初步分析該基因的表達組織及表達定位。這個新功能基因的克隆與鑑定對揭示CMN分子機制和闡明眼球運動控制的機制有重要價值。

結題摘要

先天性運動性眼球震顫（CMN）是以眼球不自主往復擺動為特徵的一類單基因遺傳病。已知單純CMN基因位點有6個，其中只有NYS1位點的FRMD7基因被確定；合併眼球震顫的疾病及相關基因則比較多。本項目在我們此前定位的CMN基因位點NYS7的基礎上，通過進一步研究發掘該位點致病基因，系統分析CMN的分子遺傳學基礎。通過外顯子組測序分析、全基因組測序分析和傳統Sanger測序分析，排除了NYS7定位區域已知基因及可能的功能基因片段與CMN的關係。通過外顯子組測序分析73個CMN家系的28個先天性眼球震顫相關基因，結果在40（40/73，54.8%）個家系檢測到可能的致病突變，其中35個家系有FRMD7基因突變、3個家系有CACNA1F基因突變、1個家系有CACNA1A基因突變、1個家系有PAX6基因突變。這些結果不僅讓我們比較全面了解CMN的致病基因變異頻譜、基因表型關係，而且也為CMN基因突變檢測的臨床套用以及進一步發掘新致病基因奠定了基礎。