E-value

資料庫用擬合係數,數值越低代表擬合度越高。

基本介紹

  • 中文名:期望值
  • 外文名:E-value(Expect value)
  • 公式:E=kmne^(-λs)
  • 網路釋義:資料庫用擬合係數
EXPECT
E期望值(E-value)這個數值表示你僅僅因為隨機性造成獲得這一alignment結果的可能次數。這一數值越接近零,發生這一事件的可能性越小。從搜尋的角度看,E值越小,alignment結果越顯著。你可能會想為搜尋設定一個期望值閾值(EXPECT),例如Defaults值設為10。這一設定則表示聯配結果中將有10個匹配序列是由隨機產生,如果聯配的統計顯著性值(E值)小於該值(10),則該alignment將被檢出,換句話說,比較低的閾值將使搜尋的匹配要求更嚴格,結果報告中隨機產生的匹配序列減少。
E=kmne^(-λs)

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