DNase I

DNase I

DNase I(Deoxyribonuclease I):中文名稱為脫氧核糖核酸酶I,是一種可以消化單鏈或雙鏈DNA產生單脫氧核苷酸或單鏈或雙鏈的寡脫氧核苷酸的核酸內切酶。DNase I水解單鏈或雙鏈DNA後的產物,5'端為磷酸基團,3'端為羥基。DNase I活性依賴於鈣離子,並能被鎂離子或二價錳離子激活。鎂離子存在條件下,DNase I可隨機剪下雙鏈DNA的任意位點;二價錳離子存在條件下,DNase I可在同一位點剪下DNA雙鏈,形成平末端,或1-2個核苷酸突出的粘末端。
特點:不含RNase(RNasefree),可以用於各種RNA樣品的處理。提供了用於DNaseI失活所需的EDTA。
用途:製備不含DNA的RNA樣品;RT-PCR反應前RNA樣品中去除基因組DNA等可能的DNA污染;體外T7, T3, SP6等RNA Polymerases催化的RNA轉錄後去除DNA模板;DNaseIfootprinting研究DNA-蛋白質相互作用;缺口平移(nicktranslatioin);產生DNA隨機片斷文庫;細胞凋亡TUNEL檢測中部分剪下基因組DNA作為陽性對照。
來源:從牛胰腺純化得到。
分子量:約32kDa(單體)。
活性定義:37℃10分鐘內,將能夠完全降解1μg pBR322質粒DNA所需的酶量定義為1個活性單位。
活性檢測條件:40mM Tris-HCl(pH8.0),10mM MgSO4,1mM CaCl2,1μg of pBR322 DNA。
純度:不含其它DNA內切酶和外切酶,不含RNA酶。
酶儲存溶液:50mM Tris-acetate(pH7.5),10mM CaCl2,50%(v/v)glycerol。
Reaction Buffer(10X):100mM Tris-HCl(pH7.5 at 25℃),25mM MgCl2,1mM CaCl2
失活或抑制:加入EDTA至終濃度為2.5mM後,65℃加熱10分鐘可使DNaseI失活。酚氯仿抽提也可以使DNaseI失活。金屬離子螯合劑,達到毫摩爾/升濃度的鋅離子,0.1%的SDS,DTT、巰基乙醇等還原劑,50-100mM以上鹽濃度均對DNaseI有顯著抑制作用。
此外,在對染色質進行低DNaseI處理,可發現酶切割將先發生在少數特異性位點上,這些特異性位點叫做DNaseI超敏感位點(DNaseI Hypersensitive Sites,DHSs ),它實際上是一段長約200bp的DNA序列特異暴露的染色質區域,甲基化程度較低,富含HMG14,HMG17蛋白,一般在轉錄起始附近或者相關部位。

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