CTP依賴核黃素激酶（英語：CTP-dependent riboflavin kinase，EC 2.7.1.161，Methanocaldococcus jannaschii Mj0056, Mj0056）是一種系統名為CTP:riboflavin 5′-phosphotransferase的酶。 此酶催化下列化學反應：CTP + 核黃素 CDP + FMN這種古菌中存在的酶使用CTP而非ATP作為核苷酸供體，因而得名。
