CTCF

CTCF(CCCTC binding factor),是CTCF基因編碼的轉錄因子,與絕緣子的活性相關。

基本介紹

  • 中文名:轉錄阻抑物
  • 簡稱:CTCF
  • 又叫1:1-鋅指蛋白或CCCTC-結合因子
  • 功能:通過與H-19印記控制區域
作用,實驗,

作用

CTCF蛋白在印記調控區域(imprinting control region,ICR)和分化甲基化區域1(differentially-methylated region-1,DMR1)和MAR3結合抑制胰島素樣生長因子2(Igf2)基因的過程中起重要作用。CTCF與靶順序因子的結合可阻斷增強子和啟動子的相互作用。從而將增強子的活性限制在一定的功能區域。除了阻斷增強子外,CTCF還可作為染色質屏障阻止異染色質的傳播。人類基因組有將近一萬五千個CTCF絕緣體位點,說明CTCF在基因調控方面的功能廣泛。而且CTCF結合位點還可作為核小體定位錨。

實驗

CTCF是廣泛存在於真核生物中的多功能轉錄因子.利用細胞瞬時表達實驗在HeLa細胞系中研究CTCF各結構域的轉錄活性.方法:借用CheckMate哺乳動物雙雜交系統的2個質粒pBIND和pG5LUC,將CTCF的N、M、C段及全長編碼序列克隆至pBIND質粒的GALA DNA結合結構域編碼序列後的多克隆位點,將表達GALA DNA結合結構域-CTCF融合蛋白的pBIND重組質粒與由腺病毒晚期主要啟動子控制的報告基因質粒pG5LUC共轉染HeLa細胞系,檢測CTCF各結構域對報告基因表達水平的影響.結果:轉染含CTCF N段的質粒可使報告基因的表達量增長至3.5倍以上;轉染含CTCF其他片段的質粒對報告基因的表達沒有明顯的影響.結論:在HeLa細胞中,對啟動子具有轉錄激活活性的主要是CTCF的N段,而M段和C段幾乎沒有轉錄激活活性.

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