2012年6月20日，交通運輸部水科院成功舉辦了《京杭運河全線通航研討會》。原交通部長錢永昌，原山東省政協副主席李殿魁，部水運局解曼瑩副局長和航道處鄭清秀處長，國家發改委基礎產業司丘其璋調研員，交通運輸部水科院院長張寶晨、副院長費維軍、政協委員蘇國萃，原山東省港航局等領導和北京、天津、河北、山東濟寧等省市交通、海事、航運、航道部門的負責人以及黃河水利委員會、清華大學、山東省交通規劃設計院等單位的相關負責人和專家出席了會議。
張寶晨院長為本次會議致辭，並在會議結束前發表了熱情洋溢的總結性發言，對於京杭運河全線通航的研究工作給予充分肯定。老部長錢永昌、解曼瑩副局長、發改委邱其璋調研員等都做了發言。北京市、天津市、河北省和山東省沿河各地市交通和航運部門分別匯報了其所轄段京杭運河的現狀和航運規劃。特邀專家李殿魁副主席、許雲飛研究員依據對京杭運河全線通航持續多年的研究成果，在會上做了演講，分析京杭運河歷史價值和現代存在的問題，並提出今後發展思路。全國政協委員蘇國萃發言，對京杭運河黃河以北段的通航進行綜合分析；本次會議通過大螢幕視頻，展示了我院對京杭運河全線通航的研究工作歷程，從2007年至今該項目組成員走遍了京杭運河全線大部分里程，做了大量前期研究工作。
會議上，交通行業高層領導和專家直接面對面探討京杭運河全線復航問題，表示京杭運河全線通航事關全國航道網的“一縱”能否貫通的大事，事關華北地區生態環境、國家節能減排大計，是一項完善我國綜合運輸網路、推進現代化交通的時代工程，是傳承中國傳統文化、光大民族形象、再創中華文明的偉大工程，也是一項為民造福的民心工程。因此是一項值得去終生為之奮鬥的工程。
會議從理論和實踐的高度分析了京杭運河斷航和至今不能全線復航的主要原因和關鍵因素。探討了運河過黃（河）和水源等問題，通過研討，思路清晰了，工作目的明確了，方法措施有底了，從而統一了思想，進一步提高了信心和勇氣。與會領導和代表一致認為：現在實施京杭運河全線復航工程的時機已經成熟，必須抓緊提到政府的議事日程。
與會領導、專家和沿河各省市代表一致認為：這是一次成功的、圓滿的學術研討會，達到了預期目的。會議希望：國家有關部門應進一步提高對京杭運河全線復航的關注度，加強宣傳，開展復航前的準備工作，四省市應加強協調、密切合作，把全線復航工作進一步推向深入。
