基督教龍港主恩堂建立於1984年，曾先後四次借用信徒家庭作為聚會場所。直到1986年才以65000元人民幣購來塑膠廠廠房作為固定聚會場所。堂址座落在蒼南縣龍港鎮環河路20號。
隨著龍港不斷發展和遷居龍港及新相信信徒的增加，於1990年6月25日在原址上破土動工興建教堂，至1991年5月8日竣工落成。“主恩堂”堂名由全國政協副主席、時任基督教全國兩會主席、會長丁光訓主教，於1990年12月8日訪問我堂時命名的。
建堂以來，先後有美國、英國、加拿大、非洲及港澳地區教會代表團訪問我堂。使我堂在國際知名度得到提高，同時又增進教會之間的了解和靈里交通。
建堂以來，我們親眼地看到、親身地經歷到主的帶領和同在，廣大信徒和睦同居、樂作主工奉獻身心，教會復興福音興旺。教會現有專職工人3位（神學生2位、駐堂1位），教會設“長執會”和“堂委會”分別負責信徒牧養探望和主持處理堂務日常事工並下設22個組。參加聖工的中青年弟兄姊妹約300餘人。教會硬體條件不斷改善，先後在主、副堂及主日學教室安裝了閉路電視、空調和電腦顯示屏。主日暨周間聚會正常，並定期舉行各種培靈會。教會規章制度及檔案不斷完善。又於1999年成功地改革以往主日輪流禱告，改為現在的同心出聲禱告和聖餐周餐改為月餐，收到了良好的效果。
信徒自1984年的14戶增至現在地1300餘戶，於1997年在人民路730號分設天恩堂，又於2002年經縣府民宗局（495）號檔案批准登記，在龍港紡織五街160號分設主愛堂。教會現有三支唱詩班（老、中、青）擔任主日獻詩。主日學七個班級，任課老師25位。1997年創辦全縣首家由教會創辦的老人之家。02、04年暑假成功地舉辦了大學生團契會。書刊部全天候供應浙南閩東周邊教會所需的各種屬靈書籍。推動縣兩會聖經專修班的創辦和為蒼南教會培養人才提供了基地，縣聖經專修班自1993年在我堂創辦以來，歷辦六屆先後有200餘位青年弟兄姊妹結業，有的考上了浙江、華東、金陵神學院，為緩解蒼南教會講台供應緊缺的局面，起到了不可代替的作用。歷年聖誕節感恩奉獻款項均名列全市教會之首。我堂還參與全國兩會、溫州市兩會出版發行的《讚美詩新編》、《讚美詩歌增訂本》編輯工作。
“主恩堂”顧名思義，主恩實在更多。回想主愛深覺虧欠和軟弱，數算主恩心被恩感充滿信心，我們決心在群羊的大牧人耶穌基督帶領下，與時俱進開拓進取。我堂願與普世教會一起，在充滿希望的21世紀裡，為傳揚主的福音，付上應有的本份。願主堅立我們手頭所作的工，我們手所作的工願主堅立；我們相信：在上主的祝福下，這殿後來的榮耀必大過先前的榮耀。
