魚類行為與進化學科組主要從事魚類行為學和魚類進化生物學兩個方面的研究。在魚類行為學方面，主要以鰟鮍魚類、鱖魚及其它鯉科魚類作為模式，研究魚類的繁殖行為、攝食行為、學習行為，和行為的發育等，以便理解動物行為學的普遍規律，從而更好地進行魚類資源開發利用和保護。在魚類進化生物學方面，我們的研究興趣主要集中在東亞淡水魚類的起源和進化方面。通過整合分子和形態學數據，採用分子系統發育分析及系統發育比較的方法，重建東亞淡水魚類尤其是鯉形目魚類的系統發育關係，研究它們的物種分化模式及過程，表型和基因型隨時間和空間的變化，進化的節奏及模式等。
在研項目,近年來發表文章,
在研項目
1. 鱖魚攝食行為發育及特殊餵食方式的比較研究（國家自然科學基金面上項目，2007－2009）
2. 東亞晚中生代以來淡水魚類主要類群的演化格局與地質背景（國家自然科學基金重點項目，2005－2009）
3. 鯉形目魚類生命之樹Cypriniformes——Tree of Life（國際合作項目，2004－2009）
4. 平鰭鰍科魚類分子系統發育及物種分化事件研究（國家自然科學基金面上項目，2008－2010）
5. 鰟鮍魚類繁殖行為生態學研究（國家自然科學基金面上項目，2010－2012）
近年來發表文章
2005年
Wang, X & Liu, H. Phylogenetic relationships of the Chinese cyprinid genus Rhinogobio Bleeker (Teleostei: Cyprinidae) based on sequences of the mitochondrial DNA control region, with comments on character adaptations. Hydrobiologia, 2005, 532: 215-220.
Tang, Q., Liu, H., Yang, X., and Nakajima, T. Molecular and morphological data suggest that Spinibarbus caldwelli (Nichols) (Teleostei: Cyprinidae) is a valid species. Ichthyological Research. 2005, 52(1): 77-82.
2006年
Tang, Q., Liu, H., Mayden, R. & Xiong, B. Comparison of evolutionary rates in the mitochondrial DNA cytochrome b gene and control region and their implications for phylogeny of the Cobitoidea (Teleostei: Cypriniformes). Molecular phylogenetics and Evolution, 2006,39:347-357.
Yang, J., He, S., Freyhof, J., Witte, K. & Liu, H. The phylogenetic relationships of the Gobioninae (Teleostei: Cyprinidae) inferred from mitochondrial cytochrome b gene sequences. Hydrobiologia, 2006,553:255-266.
Liu, H., Zhu, Y., Smith, C. & Reichard, M. Evidence of host specificity and congruence between phylogenies of bitterlings and freshwater mussels. Zoological Studies, 2006, 45(3):428-434.
Reichard M., Ondracková, M., Przybylski, M., Liu, H. & Smith, C. The costs and benefits in an unusual symbiosis: experimental evidence that bitterling fish (Rhodeus sericeus) are parasites of unionid mussels inEurope. Journal of Evolutionary, 2006, 19:788-796.
曾燏，劉煥章，沈建忠，2006．鰟鮍魚類產卵時對河蚌鰓不同位置的選擇．動物學報，52 (2)：272-278．
朱玉蓉，劉煥章，2006．大鰭鱊基於細胞色素b基因序列的遺傳變異及生物地理過程．水生生物學報，30(2)：134-140.
2007年
Reichard M, Przybylski M, Kaniewska P, Liu H, Smith C. A possible evolutionary lag in the relationship between freshwater mussels and European bitterling. Journal of Fish Biology, 2007, 70: 709-725.
Reichard M, Liu H, Smith C. The co-evolutionary relationship between bitterling fishes and freshwater mussels: insights from interspecific comparisons. Evolutionary Ecology Research, 2007, 9: 239-259.
Smith C, Zhu Y, Liu H, Reichard M. Deceptive female oviposition behaviour elicits male ejaculation in the European bitterling. Journal of Fish Biology, 2007, 71: 1841-1846
2008年
Chang M, Wang X, Liu H, Miao D, Wu G, Liu J, Li Q, Sun Z, Wang N. Extraordinarily thich-boned fish linked to the aridification of the Qaidam Basin (northern Tibetan Plateau). PNAS, 2008, 105(36):13246-13251.
Zhang L, Tang Q, Liu H. Phylogeny and speciation process of the eastern Asian cyprinid genusSarcocheilichthys. Journal of Fish Biology, 2008, 72: 1122-1137.
Tang Q, Freyhof J, Xiong B, Liu H. Multiple invasions of Europe by East Asian cobitid loaches (Teleostei: Cobitidae). Hydrobiologia, 2008, 605:17-28.
He Y, Tang Q, Wang J, Liu H, Tan D. Population differentiation ofProcypris rabaudi(Tchang) in the upper reaches of theYangtze Riverrevealed by mitochondrial DNA and RAPD markers. Genes & Genomics, 2008, 30(3):223-233.
唐瓊英，俞丹，劉煥章．斑紋薄鰍Leptobotia zebra應該為斑紋沙鰍Sinibotia zebra．動物學研究，2008，29（1）: 1-9．
熊玉宇，喬曄，劉煥章，譚德清．犁頭鰍早期發育．水生生物學報，2008，32（3）：424－433．
2009年
Tang Q, Getahun A, Liu H. Multiple In-to-Africa dispersals of labeonin fishes (Teleostei: Cyprinidae) revealed by molecular phylogenetic analysis. Hydrobiologia, 2009, 632:261-271.
Yu D, Ding B, Liu H. Isolation and characterization of 11 polymorphic microsatellite loci for theSaurogobio dabryi(Teleostei: Cyprinidae). Conservation Genetics Resources, 2009, accepted.
劉思情，張家波，唐瓊英，劉煥章．基於ND4和ND5基因序列分析的鰍超科魚類系統發育關係．動物學研究，2009，已接收．
