《魂歸鯉魚溪》以台灣同胞尋根問祖為主線,採用散文體的結構,運用鏡頭閃回的手法,從一個細小的故事出發,營造了一幅中國南方小鎮的美麗山水畫卷;塑造了一群民風淳樸、可親可愛的家鄉人;展現了一個文化底蘊深厚、生態環境優美、人魚同樂、和諧共處的世界,反映了兩岸親情一脈相承、落葉歸根的主題思想。從小在台灣長大的女孩圓圓(王思蒙飾),帶著爺爺(劉韌 飾)臨終的遺願,回到了爺爺曾經成長生活過的故鄉——福建周寧鯉魚溪。
在這個完全陌生的地方,她找到了爺爺的妹妹等家人,並結識了一位啞巴表哥奇仔(田七飾)。在逐步實現爺爺遺願的過程中,在與家人和村民的交往中,透過圓圓的視角,通過她在這裡的所見所聞所感,將一段段難忘的往事與一個引人入勝的鯉魚溪呈現出來。