高等真核生物基因組是由成千上萬的基因及散在的非編碼序列組成，這些序列高度凝縮排列在特定的染色體上。染色質組織區中的DNA序列、染色質結構中的蛋白質複合物以及核的結構組分，為時空性的基因表達提供了適當的亞核（subnuclear)環境。
基因、調控元件和重複序列在染色體上以凝縮鑲嵌或者開放區域散在分布，不同類型染色質間的相鄰距離能
夠對鄰近基因的表達產生正向或反向的影響。一方面，染色質結構的改變能夠通過靶向特異性染色質因子的去定位而影響DNA活動，另一方面，根據重排狀態，位於異染色質鄰近部位的基因可能會在一系列細胞中表達沉默，導致由於位置效應而引起的基因表達的花斑模式（varicgated patem)。除此之外，不同類型的位置效應一定程度上能夠在全基因水平影響基因的表達模式。
夠對鄰近基因的表達產生正向或反向的影響。一方面，染色質結構的改變能夠通過靶向特異性染色質因子的去定位而影響DNA活動，另一方面，根據重排狀態，位於異染色質鄰近部位的基因可能會在一系列細胞中表達沉默，導致由於位置效應而引起的基因表達的花斑模式（varicgated patem)。除此之外，不同類型的位置效應一定程度上能夠在全基因水平影響基因的表達模式。
