馬日本乙型腦炎(Japanese equine B encephalitis)又稱流行性乙型腦炎。是指日本腦炎病毒引起的一種馬急性傳染病。日本腦炎病毒屬披風病毒科、黃病毒屬，或稱B群蟲媒病毒。蚊蟲為傳播媒介，季節性發病。幼駒發病多，成年馬隱性感染。病馬呈髒炎症狀，沉鬱和興奮交替出現。腦的變化為典型的非化膿性腦炎。
根據流行特點、臨診症狀、病理組織學檢查，可作初步診斷；確診靠病毒分離和血清學試驗。除蚊滅蚊是預防重要措施，對幼駒可用乙型腦炎弱毒疫苗預防接種。採取降低顱內壓，調整大腦機能及解毒等綜合性對症療法，有利於病馬康復。
