顏海飛,男,中國科學院大學專任教師。
基本介紹
- 中文名:顏海飛
- 國籍:中國
- 畢業院校:南京林業大學
- 學位/學歷:博士
人物經歷,教育背景,工作經歷,研究方向,科研成果,發表論文,科研項目,
人物經歷
教育背景
2003-09--2008-07 華南植物園 博士畢業
1999-09--2003-07 南京林業大學 學士畢業
1996-09--1999-07 海鹽中學 高中畢業
工作經歷
2015-10~2016-10,亞利桑那大學, 訪問學者
2013-08~現在, 華南植物園, 副研究員
2008-07~2013-07,華南植物園, 助理研究員
研究方向
1. 物種多樣性格局的形成機制研究
全球的物種多樣性呈現出不均衡分布的格局,東亞物種多樣性明顯高於北半球的其他地區(尤其是北美和歐洲),是什麼原因導致了這種分布格局的形成一直是生物學家關注的重要課題。物種形成淨速率和起源時間是物種多樣性形成的最直接原因。我們可利用不同植物(或動物)類群在全球不平衡的物種多樣性格局,結合其系統發育關係和分化時間,估算出不同地區的物種形成淨速率和起源時間,進而推算物種多樣性格局的形成機制。此外,在東亞內部,可進一步將東亞地區細分(如依據區系、緯度、經度、海拔等),結合多個類群(植物類群)的系統發育關係,及其的重要性狀(如花的結構、種子形態等)和生態因子(如溫度、降水、土壤類型等)等性狀,開展巨觀的比較系統發育學研究,探討東亞物種多樣性形成機制。
2. 植物系統發育與進化研究
隨著高通量測序和生物信息技術的快速發展,利用高通量數據手段開展植物系統發育和進化研究屬於研究熱點。我們正利用轉錄組測序(RNA-seq)、基因組淺層測序技術(Genome Skimming)、同源基因雜交測序法(Target enrichment combined with genome skimming: Hyb-Seq)獲取大量直系同源核基因或細胞器基因組信息,並結合形態、細胞學、生境因子等數據探討植物類群(如報春花科)的系統發育關係和物種形成的地理模式。另外,以特定植物類群(如植物複合體)為例,利用簡化基因組測序(RAD-seq)或轉錄組測序開展群體遺傳學方面的研究,並結合植物地理學和古生物、古地理和古氣候的資料,探討其起源、演化和分布歷史,揭示物種間的進化規律和機制。
3. 植物DNA條形碼研究
DNA條形碼是採用標準的DNA片段對物種進行有效鑑定的技術。在植物中,由於存在較為頻繁的雜交和基因漸滲,該技術在植物中可能存在較多問題。當前,我們正利用基因組淺層測序技術(Genome Skimming)等高通量測序方法構建超級條形碼(細胞器基因組及核糖體基因),以解決近緣類群的物種鑑定問題,進而發現其中的生物學問題。除DNA條形碼的選擇標準和鑑定能力的評估外,我們試圖探討如何將DNA條形碼技術有效地套用於種下品系的鑑定中(如鑑定重要中藥材的道地性)。
科研成果
發表論文
(1) Chloroplast genomes and comparative analyses among thirteen taxa within Myrsinaceae s.str. clade (Myrsinoideae, Primulaceae). International Journal of Molecular Sciences, International Journal of Molecular Sciences, 2019-09, 通訊作者
(2) Characterization of the plastid genome of the monotypic genus Bryocarpum (Primulaceae), Mitochondrial DNA Part B, 2019-09, 通訊作者
(3) The complete chloroplast genome of Ardisia crenata Sims (Primulaceae): a popular ornamental plant in China, Mitochondrial DNA Part B, 2019-05, 第 2 作者
(4) The plastid genome and its implications in barcoding specific-chemotypes of the medicinal herb Pogostemon cablin in China, Plos ONE, 2019-04, 通訊作者
(5) Characterization of the complete plastid genome of an endangered species Fortunearia sinensis (Hamamelidaceae), Mitochondrial DNA Part B, 2019-04, 通訊作者
(6) Liparis napoensis (Orchidaceae), a new species from Guangxi, China, PhytoKeys, 2019-03, 第 5 作者
(7) The complete chloroplast genome of a true mangrove Sonneratia apetala and its phylogenetic implications, Mitochondrial DNA Part B, 2019-01, 通訊作者
(8) The complete chloroplast genome of a true mangrove Sonneratia apetala and its phylogenetic implications, Mitochondrial DNA Part B, 2018-12, 第 4 作者
(9) What explains high plant richness in East Asia? Time and diversification in the tribe Lysimachieae (Primulaceae), New Phytologist, 2018, 第 1 作者
(10) The complete chloroplast genome of a rare candelabra primrose Primula stenodonta (Primulaceae), Conservation Genetics Resources, 2017, 通訊作者
(11) Lysimachia sinopilosa (Primulaceae), a new species from Yunnan, China, Annales Botanici Fennici, 2017, 第 1 作者
(12) 植物DNA條形碼研究進展及在中草藥鑑定領域的套用, 中草藥, 2017, 通訊作者
(13) Characterization of Novel Microsatellite Loci for Primula poissonii (Primulaceae) Using High-Throughput Sequencing Technology, Molecules, 2016, 通訊作者
(14) Complete plastid genome sequence of Primula sinensis (Primulaceae): structure comparison, sequence variation and evidence for accD transfer to nucleus, PeerJ, 2016, 第 4 作者
(15) The Use of DNA Barcoding on Recently Diverged Species in the Genus Gentiana (Gentianaceae) in China, PLoS ONE, 2016, 第 2 作者
(16) Phylotranscriptomic analysis Based on coalescence was less Influenced by the Evolving Rates and the Number of Genes: A Case Study in Ericales, Evolutionary Bioinformatics, 2016, 第 3 作者
(17) DNA barcoding evaluation and its taxonomic implications in the species-rich genus Primula L. in China, PLoS ONE, 2015, 第 1 作者
(18) A Remarkable New Species of Liparis (Orchidaceae) from China and Its Phylogenetic Implications, PLoS ONE, 2013, 通訊作者
(19) Population expanding with the phalanx model and lineages split by environmental heterogeneity: a case study of Primula obconica in subtropical China, PLoS ONE, 2012, 第 1 作者
(20) Lysimachia huchimingii sp. nov. (Primulaceae) from China, Nordic Journal of Botany, 2012, 第 1 作者
(21) Testing DNA barcoding in closely related groups of Lysimachia L. (Myrsinaceae), Molecular Ecology Resources, 2012, 通訊作者
科研項目
( 1 ) 海仙花複合體生境適應分化機制研究, 主持, 國家級, 2013-01--2016-12
( 2 ) 基於葉綠體基因組構建輻射演化類群報春花屬系統發育框架的研究, 主持, 國家級, 2016-01--2019-12
( 3 ) 報春花屬海仙花複合體的雜交物種形成研究, 主持, 省級, 2015-01--2018-01
( 4 ) 我國華南及周邊地區報春花資源調查與引種栽培, 主持, 省級, 2016-01--2018-12
( 5 ) 採用葉綠體基因組研究重要園藝類群報春花屬植物的親緣關係, 主持, 省級, 2016-04--2019-03
( 6 ) 我國珍珠菜屬(報春花科)海拔物種多樣性格局及其成因的研究, 主持, 國家級, 2019-01--2022-12