青島大學高能物理套用研究院是學校直屬科研機構，主要從事高能物理研究、微型核反應堆開發套用研究、先進加速器技術研究及開發、先進射線技術與套用，高能雷射技術套用研究等。
青島大學高能物理套用研究院其中最主要研究方向是圍繞高能強流加速器的設計、製造和套用及拓展套用研究。此外，研究院的另一個主要研究方向是自然安全原則在核反應堆的套用，推動中國微型核反應堆設計邁入自然安全時代。
青島大學高能物理套用研究院將在凝聚態物理、材料科學、生物、醫學、地礦、礦等領域開展研究成為我國此領域的重要研究基地，高能院與世界幾十所大學和科研機構建立了長期穩定的合作關係，積極參加大型高能物理實驗國際合作，必將有力地促進我國相關領域的研究和高技術發展。
