水產品深加工技術國家地方聯合工程研究中心是經國家發展和改革委員會於2015年12月批覆建設的創新平台（發改高技[2015]3173號）。該平台依託集美大學，在原省級創新平台"福建省水產品深加工工程研究中心"的基礎上，整合集美大學的優勢資源建設而成，由副校長曹敏傑教授任"中心"主任。"水產品深加工技術國家地方聯合工程研究中心"致力於建設成為國內一流水平的水產品精深加工科學理論和技術研究開發的綜合平台。
中心已經建成2個研發基地和2箇中試基地，擁有總建築面積3100㎡；中心已投入300多台/套現代化科研設備，並組成了多條專業化的中試生產線，具備自主研發產品、產品小試、中試的硬體條件以及將科技成果向規模化生產的工程化研究驗證能力，已將多項技術在企業進行規模化生產套用，取得了良好的經濟及社會效益。
