陸間裂谷與大陸裂谷具有密切的成因聯繫,它是在大陸裂谷基礎上進一步演化的結果。在大陸裂谷的基礎上,當岩石圈上部伸展變薄已達到軟流圈等勢面的深度時,軟流圈物質沿裂谷軸部貫入、溢出,新洋殼開始形成,大陸岩石圓板塊徹底分裂並開始向兩側離散,海水淹沒了整個谷底。於是,陸內裂谷盆地演化成具有擴張脊的狹窄洋盆或陸間裂谷盆地。
陸間裂谷(intercontinental rft) 的兩側是大陸地殼,盆地基底不是陸殼而是過渡型地殼和大洋地殼。例如紅海、亞丁灣、加利福尼亞灣等。與大陸裂谷帶不同的是,陸間裂谷中軸部分將出現顯著的拉斑玄武質岩漿活動,甚至產生低鉀的類似於MORB的拉斑系列岩漿活動,說明隨著大陸板塊的分裂,岩漿的鹼度逐步下降,直到形成大洋裂谷,而成為洋中脊或類洋中脊構造環境和近似的岩漿活動和火成岩組合。