陝西省水產研究所始建於1960年，為公益性全額撥款事業單位，隸屬於陝西省水利廳。先後承擔農業部、科技部、中國水產科學研究院、省科技廳、省水利廳等上級部門下達的科研項目200餘項。
單位正式編制105人，在職96人。專業技術人員60人，研究員5人，其中高、中級專業技術職稱38人，初級及以下技術職務17人,省突出貢獻專家1人，省新世紀“三五”人才1人，享受政府特殊津貼1人，碩士研究生以上學歷12人。
單位固定資產5000萬元。有漁業資源與環境保護、水產品質量安全檢測與風險評估、水產養殖與病害防治、分子生物學4個專業實驗室1184㎡，各種儀器設備160餘台（套）。有水產生物遺傳育種、漁業生態環境與資源保護、水產品質量安全、水產養殖與病害防治等5個專業研究室。有陝西隴縣秦嶺細鱗鮭增殖放流站、陝西省團頭魴良種場、陝西合陽水產良種場3箇中試基地，總占地面積450畝，總投資約2350萬元。
截至2015年， 先後承擔農業部、科技部、中國水產科學研究院、省科技廳、省水利廳等上級部門下達的科研項目200餘項，榮獲農業部豐收計畫、陝西省科技進步、科技推廣、陝西省水利科技進步獎50餘項，發明專利2項，出版專著1部，在核心刊物上發表學術論文近400篇。獲得國家級科技成果重點推廣技術依託單位證書、對外技術貿易證書和享受免稅政策認證書。
