阜陽市畜牧獸醫局是阜陽市人民政府工作部門。
主要職責,內設機構,
主要職責
一、貫徹執行國家有關畜牧、獸醫、飼料行業及畜產品質量安全的法律法規、產業政策和發展計畫。
二、擬定畜牧、獸醫和飼料行業發展的中長期規劃、年度計畫、政策措施並組織實施。
三、負責畜牧生產、產業化和統計工作；組織實施畜禽遺傳資源保護；擬定畜牧獸醫相關地方標準和技術規範。
四、負責動物防疫、檢疫、動物衛生監督和重大動物疫病防控，監測疫情並組織撲滅。
五、負責獸醫醫政、獸藥藥政、飼料行業管理和畜產品質量安全監督管理。
六、負責畜牧、獸醫、飼料行業的技術推廣和對外交流與合作；負責畜牧獸醫職業技能鑑定。
七、指導下級畜牧獸醫管理機構和相關學會、協會工作。
八、承辦市委、市政府及上級業務部門交辦的其他工作。
九、根據市編委《關於市畜牧獸醫局增設內設機構的批覆》（阜編〔2014〕61號）批覆，增設畜禽屠宰管理辦公室，職責：宣傳貫徹落實國務院、省政府和市政府關於定點屠宰方針、政策、法規、規章和有關標準，落實屠宰行業發展規劃，負責畜禽屠宰行業統計；負責畜禽屠宰環節質量安全監督管理等工作。
內設機構
辦公室
負責文電、機要、保密、信息、宣傳、信訪、督辦、網站管理等工作;擬定機關有關管理制度並組織實施;承辦重要會議;負責有關綜合性報告、檔案、工作總結的起草，負責相關規範性檔案的審核;負責機關及下屬單位相關資產的管理;負責機關接待活動；負責文明創建和綜合治理等工作。
人事財務科
負責機關和直屬單位人事、財務管理工作;負責幹部任免、獎懲、人才引進等工作;組織畜牧獸醫專業技術人員職稱評聘;負責年度考核、工資變動、人員培訓、人事統計、檔案管理等工作;編報年度部門預決算，並負責執行;負責機關工作經費和專項經費收支的審核、報銷、賬簿登記工作;監督畜牧獸醫專項資金、項目資金的使用和管理;負責國有資產管理、財務審計工作;負責離退休幹部管理和服務等工作。
畜牧科
貫徹執行國家有關畜牧、種畜禽和草業工作的法律、法規和規章；研究提出畜牧、草業發展規劃和計畫及政策建議，並組織實施;負責畜牧生產、市場信息、結構調整、標準化及產業化工作;負責種畜禽、草業的行政管理及相關行政許可的審核、審批;組織開展畜牧業遺傳資源管理;保護、開發、利用和畜牧業環境保護工作;負責畜牧生產項目的篩選、實施和管理;負責招商引資工作;指導專業合作經濟組織建設等工作。
獸醫科
貫徹執行國家有關動物防疫等法律、法規和規章;研究提出動物防疫、獸醫醫政管理規劃和計畫及政策建議，並組織實施;負責動物防疫工作，組織實施全市重大動物疫病防控，承擔市防治重大動物疫病指揮部辦公室日常工作;指導動物及動物產品的衛生監督、管理工作;負責獸醫醫政行政管理工作;負責官方獸醫、執業獸醫、鄉村獸醫的管理與培訓;負責動物診療機構的管理;負責獸醫工作項目的篩選、 實施和管理;負責獸醫生物實驗室的安全管理等工作。
畜產品質量安全監管科(畜牧行政執法支隊)
貫徹執行國家有關畜產品質量安全、獸藥、飼料和飼料 添加劑管理等法律、法規和規章；研究提出畜產品質量安全、獸藥、飼料和飼料添加劑的管理規劃和計畫及政策建議，並組織實施；負責畜產品質量安全監管，承擔全市畜牧業生產投入品(含奶站)的監督管理工作，擬定獸用違禁藥品、獸藥殘留監控和獸藥飼料抽檢計畫並組織實施；負責獸藥、飼料和飼料添加劑的行政管理及相關行政許可的審核、審批，負責地方媒體發布的獸藥、飼料添加劑廣告審查；負責畜牧獸醫相關的法律、法規和規章的宣傳工作；負責制定普法規劃和年度普法計畫；受理有關行政複議、行政訴訟、行政賠償等事項；協助相關部門做好無公害、綠色、有機畜產品認證;履行畜牧獸醫等行政執法的監管、指導、協調職能；負責對畜牧獸醫行政案件的監督、評查和法制培訓等工作。
畜禽屠宰管理辦公室
宣傳貫徹落實國務院、省政府和市政府關於定點屠宰方針、政策、法規、規章和有關標準，落實屠宰行業發展規劃，負責畜禽屠宰行業統計；負責畜禽屠宰環節質量安全監督管理等工作。
機關黨委辦事機構、紀檢（監察）機構設定，按有關規定執行。
