2006年5月阜康市三工河哈薩克民族鄉和水磨溝哈薩克民族鄉中心學校合併至三小，學校成為了融漢、維、哈、回、蒙等13個民族為一體的全日制寄宿制國小。
阜康市第三國小的操場是多功能操場，全疆唯一一個，全國2個，具有足球場，輪滑道，跑步道羽毛球場等功能。
阜康市第三國小是國家級名校，榮獲國家級獎項許多。擁有一棟專用音樂.科學實驗樓，實驗儀器精良，並有一個小型動物園，裡面有鴕鳥，環頸雉（野雞，山雞），刺蝟，信鴿，毛腳鴿，土雞，烏雞，貴妃雞，熊貓兔，獺兔，桃面情侶鸚鵡，虎皮鸚鵡，孔雀等13種動物，相當於阜康市第三國小13個民族一樣團結。其中實驗室的動植物標本豐富，有綠蟾蜍，壁虎，紅耳巴西，沙蟒，鴕鳥蛋，等十幾種動物標本。
