《長非編碼RNA AS1DHRS4調控基因表達的靶向和作用機制》是依託汕頭大學，由黃東陽擔任項目負責人的面上項目。
基本介紹
- 中文名：長非編碼RNA AS1DHRS4調控基因表達的靶向和作用機制
- 項目類別：面上項目
- 項目負責人：黃東陽
- 依託單位：汕頭大學
項目摘要,結題摘要,
項目摘要
DHRS4基因編碼的蛋白質NRDR，是體內維生素A向維甲酸轉變的關鍵酶。我們前期的研究證明，長非編碼RNA AS1DHRS4，即與DHRS4基因以頭對頭形式存在的反義轉錄本，不僅cis調節DHRS4基因，還trans調節DHRS4基因簇的另外兩個同源基因DHRS4L2和DHRS4L1的轉錄。這種調節是AS1DHRS4通過募集抑制性蛋白修飾複合體，表觀遺傳調控各個基因啟動子區域的染色質構象乃至DNA甲基化來完成的。本研究擬通過生物素標記的寡核酸沉澱，深度測序以及蛋白質組學等方法進一步闡明：1. AS1DHRS4是否特異性作用DHRS4基因簇，2. 決定AS1DHRS4與DHRS4基因簇的各個啟動子區域特異性相互作用的靶向分子機制，3. 參與反義RNA調控作用的抑制性蛋白複合體成分，4. AS1DHRS4不同序列部分的不同功能。
結題摘要
長非編碼RNA AS1DHRS4，即與DHRS4基因以頭對頭形式存在的反義轉錄本，不僅cis調節DHRS4基因，還trans調節DHRS4基因簇的另外兩個同源基因DHRS4L2和DHRS4L1的轉錄。本研究通過（1）染色質免疫沉澱技術和甲基化特異性PCR檢測發現，AS1DHRS4通過DNA甲基化協同組蛋白修飾調節DHRS4基因簇的啟動子的轉錄活性；（2）經生物素標記的寡核酸沉澱AS1DHRS4-蛋白複合物，質譜分析鑑定AS1DHRS4結合募集的蛋白分子結果顯示AS1DHRS4結合的蛋白複合物中量最多為結合核糖體和參與轉錄後修飾的蛋白；（3）克隆鑑定了不同哺乳動物DHRS4基因的反義轉錄本，發現恆河猴和小鼠中DHRS4-AS轉錄本促進DHRS4基因的轉錄，而在人肝細胞中則抑制DHRS4基因簇的轉錄活性，提示不同結構的反義RNA可能具有不同的調控效果。以上結果證實了DHRS4反義RNA對正義DHRS4基因簇在表觀遺傳學水平的調控效果，並為今後進一步研究反義RNA的調控基因表達的作用機制以及反義RNA在物種進化過程中的演變提供了資料。
