《長鏈非編碼RNA HOTAIRM1在結直腸癌中的功能研究》是依託浙江大學，由張紅河擔任項目負責人的青年科學基金項目。
基本介紹
- 中文名：長鏈非編碼RNA HOTAIRM1在結直腸癌中的功能研究
- 依託單位：浙江大學
- 項目負責人：張紅河
- 項目類別：青年科學基金項目
項目摘要,結題摘要,
項目摘要
長鏈非編碼RNA不僅參與了細胞周期、分化、凋亡和衰老，以及細胞間或細胞核心漿運輸等細胞學過程，而且還具有表觀遺傳學調控、轉錄調節、轉錄後及翻譯調節染色質重塑等重要的分子生物功能。HOTAIRM1是最近新發現的一條長鏈非編碼RNA，本課題組先期實驗結果表明HOTAIRM1在結直腸癌中表達明顯降低，並且將HOTAIRM1干擾後細胞增殖增加，但其在腫瘤中的生物學機制仍不明確，因此本研究以結直腸癌為疾病模型，以HOTAIRM1為靶點，擬採用表達載體或RNA干擾技術確定其在結直腸癌細胞中的生物學功能；利用MSP和BSP等技術研究HOTAIRM1自身表達是否受甲基化調控及特異性甲基化位點；訂製HOX基因簇的低密度晶片，篩選HOXAIRM1下游相關的HOX基因簇成員，採用功能缺失或增補實驗進一步明確HOTAIRM1通過HOX基因簇發揮生物學功能；本項目的完成將為結直腸癌的發生髮展闡釋全新機制。
結題摘要
長鏈非編碼RNA不僅參與了細胞周期、分化、凋亡和衰老，以及細胞間或細胞核心漿運輸等細胞學過程，而且還具有表觀遺傳學調控、轉錄調節、轉錄後及翻譯調節染色質重塑等重要的分子生物功能。HOTAIRM1是最近新發現的一條長鏈非編碼RNA，本課題組採用逆轉錄螢光定量PCR方法檢測了109例結直腸癌組織和配對正常結直腸黏膜組織樣本中HOTAIRM1的表達，發現HOTAIRM1在結直腸癌中的表達明顯低於正常對照組織，而HOTAIRM1的表達與患者年齡、性別、腫瘤大小、部位以及TNM分級等臨床病理特徵無關。收集150例結直腸癌患者和101例健康對照的血漿標本，將其隨機分為訓練組和確認組，使用巢氏螢光PCR檢測血漿中HOTAIRM1水平。採用logistic回歸和ROC曲線分析在訓練組中確定診斷結直腸癌的臨界值為0.003（CRC≤0.003）；在確認組該臨界值診斷結直腸癌的靈敏度為64.00%，特異度為76.50%。與目前常用的腫瘤標誌物比較，HOTAIRM1診斷結直腸癌的能力與CEA相似，但高於CA125和CA199；將HOTAIRM1與CEA聯合使用診斷結直腸癌靈敏度可以提高到84%，而且結直腸癌患者血漿中HOTAIRM1水平與患者年齡、性別、腫瘤大小、部位以及TNM分級等臨床病理特徵無關，因此血漿中HOTAIRM1水平下降是結直腸癌獨立的診斷指標。我們在結直腸癌細胞系中過表達和干擾HOTAIRM1的表達發現HOTAIRM1具有抑制結直腸癌細胞增殖的功能，晶片篩選其下游靶基因結果表明HOTAIRM1通過ECM受體信號相關通路抑制了結直腸癌的發生髮展。本項目發現HOTAIRM1可能成為結直腸癌的全新診斷分子標誌物而且為闡釋結直腸癌發生髮展的全新機制奠定了理論基礎。
