酶分離純化方法是通過將酶分離提純以獲得高度純淨的酶製劑的方法。包括抽提、純化和製劑三個環節,自1926年從刀豆中提出脲酶結晶以來,迄今已有200種左右的酶製成結晶,相當數量的酶達到高度淨化。酶的本性是蛋白質,凡可用於蛋白質分離純化的方法都同樣適用於酶,但酶易失活,故分離純化需在低溫(4℃)、溫和pH(4<pH>10)等條件下進行,與蛋白質類似,酶易在溶液表面或界面處形成薄膜而變性,因此操作中應儘量減少泡沫形成,此外重金屬易使酶失效,有機溶劑能使酶變性,微生物污染以及蛋白水解酶的存在能使酶分解破壞,這些都應予以足夠的重視。
酶分離純化的最終目的是獲得單一純淨的酶,因此,容許在不破壞“目的酶”的限度內,使用各種手段;酶與底物和抑制劑的結合常使其理化性質和穩定性發生改變,這種特性已被用於酶的分離純化,由於酶及其來源的多樣性及與之共存的高分子物質的複雜性,還很難找到一種通用的方法以適用於一切酶的純化。為了使一種酶達到高度純化,往往需要多種方法協同作用,通過酶活性的跟蹤檢測確定最佳流程。