鄭觀應稅收思想是指鄭觀應堅持“量入為出”原則,要求“必以出入之數維均”,並建議頒行“度支清帳” 。認為這是中外各國“通盤理財之法”(《盛世危言·度支》)。對厘金,曾認為“取於商者甚微,益於國者甚大,較之按畝加賦,得失懸殊”(《稅則》)。甲午戰爭後列舉厘金十病,主張廢除。關於稅則,主張“土貨出口稅宜從輕,凡我國所有者,輕稅以廣去路(出口);我國所無者重稅以遏來源”(《稅則》)。
要求以稅負之輕重來調節外貿活動,在財務行政方面,鄭觀應反對外國人主持海關總稅務司及各口稅務司的稅政大權,主張由華人擔任。 對當時“華人貪鄙,不如外人清廉”之謬說,痛斥曰: “如謂華人盡不如西人,……豈十八省之督撫亦必須以西人為之乎?”(《稅則》附錄》)同時,亦反對協定關稅制度。