工作職能
（一）負責《水土保持法》及其配套法規的貫徹落實、宣傳教育和監督檢查工作。對開發建設項目的水保方案進行審批和監督實施，依法查處破壞水土保持的案件。
（二）負責編制市水土保持發展戰略規劃和中長期計畫，會同有關部門和旗區編制上報流域綜合治理規劃和單項工程規劃，負責全市重點水保工程項目的審核、檢查和驗收。
（三）組織全市水土流失的監測監理、監督檢查和綜合治理工作，指導旗區開展水土保持生態建設與保護工作。
（四）審查上報全市水土保持工程項目建議書、可行性研究報告和初步設計。
（五）編制全市水土保持治理年度計畫，並按年度統計匯總、編報財務預決算和全市水土保持統計資料。對全市水保經費、專項資金的劃撥、使用、報帳等情況進行監督檢查。
領導班子,科室設定,
領導班子
局長：馬振綱
副局長：李玉懷、張建國、喬楠、王瑞
紀檢組長：齊采力
調研員：李恕興
世行辦副主任：韓利榮
（六）負責全市水土保持工作的開展、組織建設和行業歸口管理。貫徹落實“五荒”拍賣政策和組織發動民眾開展面上治理。
（七）協調組織跨旗區的重點水土保持工程建設。
（八）負責推進水土保持經濟區綠色經濟產業的治理開發，發展水土保持產業化工作。
（九）貫徹執行國家關於水土保持世行貸款項目工作的方針政策、發展規劃及有關規範和標準，負責水土保持項目的外資引進；管理黃土高原水土保持世行貸款項目；負責科研和科技成果的引進、試驗、示範、推廣等項工作；配合有關部門進行世行貸款的信貸、發放和回收工作。
（十）承辦市人民政府和上級業務部門交辦的其它事項。
科室設定
根據上述職責，市水土保持局內設6個職能機構：
（一） 辦公室
協助局領導處理機關日常工作，協調機關政務工作；負責會議的組織、綜合材料的起草和機關文秘、檔案、財務、保衛、保密、調研、信訪、督查、規章制度建設等工作。負責管理局機關並指導局屬單位的人事、機構編制、勞資等工作。
（二）計畫財務科
根據國家水土保持發展戰略，編制市水土保持戰略和中長期計畫及年度計畫並組織實施，按年度統計匯總、編報財務預決算和全市水土保持統計資料；組織協調流域開發工作；對全市水保經費、專項資金的劃撥、使用、報帳等情況進行監督檢查；指導全市水土保持行業產業發展、多種經營和財務、統計；負責局及局屬單位的國有資產管理等工作。
（三）工程技術管理科
審查上報全市水土保持工程項目建議書、可行性研究報告和初步設計；協調組織跨旗區的重點水土保持工程建設；負責水土保持先進技術的推廣套用及水土保持的業務培訓、宣傳推廣、科學研究和技術指導。
（四）生態建設科（沙棘辦公室）
貫徹執行國家關於水土保持治理開發和生態建設的方針政策以及規章制度、技術標準，擬定本市的相關制度和標準並監督實施；負責全市水土保持生態建設項目和砒砂岩沙棘減沙生態工程；指導旗區開展水土保持生態建設與保護工作；負責全市水土保持工作的開展、組織建設和行業歸口管理；貫徹落實“五荒”拍賣政策和組織發動民眾開展面上治理；負責推進水土保持經濟區綠色經濟產業的治理開發，抓好發展水土保持產業化工作。
（五）監督檢查科（監測評價科）
負責《水土保持法》及相關法規的貫徹落實和監督檢查；對開發建設項目的水保方案進行審批並監督實施；依法查處破壞水保的水事案件；負責全市水土流失的監測預報工作，對各項治理措施及效能進行監察評價和定量分析，為市政府定期發布水土流失情況提供科學依據。
（六）審計科
其主要職責是：貫徹“全面審計，突出重點”的方針，堅持“為生態建設服務，為經濟發展服務，為幹部隊伍建設服務，為廉政建設服務”的方向，在全市水土保持系統內開展財務收支審計、經濟契約審計、基本建設項目（概）預算執行情況和竣工決算審計，圍繞水土保持中心工作開展專項審計調查等，著重對重點單位、重點項目、重點專項資金的審計監督，維護水土保持資金的安全，加強內部管理，保障鄂爾多斯市水土保持事業健康發展。
