郡大溪位於台灣省中部,屬於濁水溪水系,為丹大溪主流 (最長河道) 上游,流域分布於南投縣信義鄉中部至東南部。郡大溪主流上游為哈伊拉羅溪,發源於海拔標高3,377米之馬利加南山東峰北側,先向西北流,匯集發源自入東郡大山的馬戛英溪後轉向西流,於無雙社附近匯入郡大溪本流,再轉北流至巴巴隆附近注入丹大溪。郡大溪本身發源於海拔標高3,765米之馬博拉斯山西南側,先西後轉北流,於無雙社附近與哈伊拉羅溪合流。