《迪茨氏屬菌降解烷烴過程中底物回響的分子機制研究》是聶勇為項目負責人，北京大學為依託單位的青年科學基金項目。
基本介紹
- 中文名：迪茨氏屬菌降解烷烴過程中底物回響的分子機制研究
- 項目類別 ：青年科學基金項目
- 依託單位 ：北京大學
- 項目負責人：聶勇
科研成果 ,項目摘要,
科研成果
序號 | 標題 | 類型 | 作者 |
|---|---|---|---|
1 | Species Divergence vs. Functional Convergence Characterizes Crude Oil Microbial Community Assembly | 期刊論文 | Guo, Peng|Yang, Yunfeng|Wu, Xiao-Lei|Zhao, Fangqing| |
2 | Diverse Bacteria with Lignin Degrading Potentials Isolated from Two Ranks of Coal | 期刊論文 | Cao, Kun|Sun, Li-Zhu|Wang, Zhi-Jian|Wu, Xiao-Lei| |
3 | Regulation of the alkane hydroxylase gene CYP153 in a Gram-positive alkane degrading bacterium Dietziasp. DQ12-45-1b | 期刊論文 | Liang, Jie-Liang|JiangYang, Jing-hong|Nie, Yong|Wu, Xiao-Lei| |
4 | Complete genome sequence of Defluviimonas alba cai42T, a microbial exopolysaccharides producer. | 期刊論文 | Sun, Ji-Quan|Nie, Yong|Tang, Yue-Qin|Wu, Xiao-Lei| |
5 | Regulation of alkane degradation pathway by a TetR family repressor via an autoregulation positive feedback mechanism in a Gram-positive Dietzia bacterium | 期刊論文 | Xiong, Guangming|Wang, Yi-Ping|Maser, Edmund|Wu, Xiao-Lei| |
6 | The complete genome of Dietzia timorensis ID05-A0528T revealed the genetic basis for its saline-alkali tolerance. | 期刊論文 | Hu, Bing|Nie, Yong|Tang, Yue-Qin|Wu, Xiao-Lei| |
7 | 細菌Dietzia sp.DQ12-45-1b中兩種長鏈烷烴羥化酶基因的鑑定 | 期刊論文 | 馬冬玲|聶勇|吳曉磊|劉立明| |
8 | Diverse alkane hydroxylase genes in microorganisms and environments | 期刊論文 | Lu, She-Lian|Lai, Guo-Li|Tang, Yue-Qin|Wu, Xiao-Lei| |
項目摘要
迪茨氏屬菌是典型的廣譜烷烴降解菌，在降解不同烷烴時表現出不同的烷烴接觸行為和代謝特徵。進一步研究發現烷烴並不能直接誘導烷烴羥化酶AlkW1的轉錄。以上結果表明迪茨氏屬菌對不同烷烴具有不同的回響機制，細胞感應烷烴後可能通過一系列的信號傳導途徑調節下游基因的表達。通過對迪茨氏屬菌25個不同菌株的核心基因組分析和基因轉錄分析，我們發現核心基因Dz_1341在烷烴代謝過程中被顯著誘導，它負責編碼雙組分系統(TCS)中的組氨酸激酶。因此我們推測雙組分系統Dz_1341/Dz_1342可能與底物回響有關，迪茨氏菌通過其感應不同烷烴調控下游基因的表達。本項目將通過基因敲除，基因轉錄分析和激酶活性研究與不同烷烴底物的對應關係；通過EMSA，ChIP-seq研究TCS調控蛋白的調控序列位點。本研究將初步揭示迪茨氏屬菌烷烴降解過程中底物回響的分子機制，為全面了解烷烴降解的分子機制和全局代謝調控提供了新的思路。
