《豬甲狀腺miRNA對生長及肉質性狀調控機制的研究》是依託浙江大學,由徐寧迎擔任項目負責人的面上項目。
基本介紹
- 中文名:豬甲狀腺miRNA對生長及肉質性狀調控機制的研究
- 依託單位:浙江大學
- 項目負責人:徐寧迎
- 項目類別:面上項目
項目摘要,結題摘要,
項目摘要
本研究採用miRNA擴增結合miRNA晶片技術研究豬甲狀腺中miRNA的表達譜;從miRNA的表達譜中篩選變化最為明顯的miRNA,定量分析驗證基因晶片的結果;並利用生物信息學獲得相應miRNA的靶基因,分析這些靶基因不同基因型對生長性狀及肉質性狀的遺傳效應。以期闡明miRNA在動物機體生長發育中的調控機制,挖掘出對豬肉產量、品質的基因工程育種的新靶基因,為生長及產肉性狀的分子改良提供新的思路和有益的線索。
結題摘要
本研究採用miRNA測序結合miRNA晶片技術研究不同生長發育時期豬甲狀腺中miRNA的表達譜;從miRNA的表達譜中篩選變化最為明顯的miRNA,定量分析驗證基因晶片的結果;並利用生物信息學獲得相應miRNA的靶基因,分析這些靶基因對生長性狀及肉質性狀的遺傳效應。 通過與miRBase 16.0資料庫進行比對,本研究首次鑑定了豬甲狀腺發育過程中表達的miRNA 804種,包含miRBase資料庫中已公布的豬miRNA 284種。通過miRNA晶片技術檢測了豬甲狀腺10個不同生長階段miRNA的表達,結果得到了248個差異顯著的miRNA(p<0.01)。進一步分析得到差異變化最為顯著的20個miRNA分別為miR-181a,miR-451,miR-199a,miR-214,miR-130a,miR-1285,miR-21,miR-191,miR-92a,miR-23a,miR-let-7e,miR-let-7c,miR-24,miR-27a,miR-148a,miR-128,miR-23b,miR-99a,miR-99b,miR-106a。利用Q-PCR技術選取了7個差異表達的miRNAs(miR-191,miR-181a,miR-92a,miR-21,miR-451,miR-128和miR-106a)在豬不同生長階段甲狀腺組織中進行了驗證,進一步確定了Solexa測序用於鑑定miRNA的真實性與可靠性。這一結果暗示,這些miRNA在豬甲狀腺發育的生物學過程中可能扮演著極其重要的調控角色。通過Targetscan對差異miRNA靶基因的預測,並結合下丘腦-垂體-甲狀腺軸上與甲狀腺功能相關的重要功能基因,篩選得到重要的功能基因為TRH、CGA、TPO以及TRHR。並對這些重要的功能基因進行了遺傳效應的分析,結果表明這些基因與豬的生長、胴體以及肉質性狀存在顯著關聯。 目前,豬甲狀腺miRNA對肉質及生長性狀基因表達調控的研究十分欠缺。miRNA介導的調控方式是基因表達調控機制中不可缺少的重要組成部分,促進了遺傳信息表達調控的深入探討。豬生長發育過程中甲狀腺組織miRNA的鑑定為進一步研究豬生長及肉質性狀的分子調控機制提供了新的參考依據,對於miRNA在動物機體生長發育中的調控機制,挖掘出提高豬肉產量、品質的新靶基因,為生長及產肉性狀的分子改良提供新的思路和有益的線索。