西藏自治區食品藥品稽查局是西藏自治區食品藥品監督管理局直屬事業單位。負責制定並組織實施食品、藥品、醫療器械、化妝品稽查制度,指導、協調、監督全區稽查工作,依法查處違法違規行為;負責開展食品、藥品、醫療器械、化妝品的抽驗工作;負責藥品、醫療器械、保健食品廣告內容的審查、審批、監測和監督工作;監督藥品網際網路信息服務和交易行為;負責食品安全保障工作;負責行政執法與刑事司法的銜接;承辦自治區食品藥品監督管理局交辦的其他事項。