礎醫學院是集教學、科研、學生管理等功能為一體的綜合性學院，其前身是成立於1978年的基礎醫學教學部，2002年更名為基礎醫學院。
基礎醫學院現有黨政辦公室、科教科、研究生科、學生科4個職能科室和6個學生工作辦公室；有人體解剖學、組織胚胎學、生理學、病理生理學、免疫學、病原生物學、細胞生物與遺傳學、生物化學與分子生物學、化學等9個教研室；有1個省級醫學基礎實驗教學示範中心、1個省級虛擬仿真實驗教學中心；有5個科研平台和1個四川省腫瘤醫學國際科技合作基地；有四川省科普教育基地1個。
基礎醫學院現有職工212人，其中專任教師146人，實驗技術人員35人。專任教師中正高級職稱占16.6%，副高級職稱占37.67%；博士占33.56%，碩士占59.59%；有出國出境學習經歷的占10.11%；有碩士研究生導師49人，博士生導師2人。有教育部“長江學者”講座教授、四川省“百人計畫”人才、四川省有突出貢獻優秀專家、教育部新世紀優秀人才、省市學術與技術帶頭人及後備人選、四川省教學名師及優秀教師、省市勞模和“三八紅旗手”、瀘州市“酒城英才”等各級各類優秀人才65人次。
基礎醫學院承擔了全校醫學、近醫、非醫等各個專業各層次學生的醫學基礎課程教學任務，開設課程174門，其中為本科生開設課程117門, 教學工作量占全校教學工作量的39.88%。學院有省級教學團隊1個，校級教學團隊4個，建設有省級精品課程5門，省級精品資源共享課程4門，數位化課程5門。學院視教學質量為生命線，以人才培養為目標積極開展教學改革研究，推動基礎醫學教學水平不斷提升。近年來，教師獲各類教學研究項目總計190項，其中省級教學研究項目7項；發表教改論文165篇，主編、參編各類教材和專著108部，獲得四川省優秀教學成果一等獎2項。
基礎醫學院擁有省級重點學科2個，校級重點學科3個，一級學科碩士學位授權點1個，二級學科碩士學位授權點6個。近三年共承擔科研課題 119項，獲科研經費1212餘萬元，其中國家自然科學基金項目資助6項、省部級34項，廳局級47項；發表論文257篇，其中三大外文核心期刊收錄57篇，核心期刊103篇，市級科研成果一等獎1項、二等獎1項。
