航海實驗教學中心成立於2002年,學院根據當時“武器系統與運用工程”、“測控技術及儀器”等五個國防重點專業和陝西省名牌專業建設情況,提出建設航海工程學院教學實驗創新基地,面向全院本科生開展專業課實驗、課程設計和畢業設計等實踐教學環節和創新性實驗研究,兼顧部分研究生課程實驗。2005年更名為航海實驗教學中心,現位於航海學院航海西樓,總建築面積1000M。實驗中心實行學院集中管理模式,配備有限的實驗室管理人員,保證實驗室設備的完好。課程的實驗由任課教師根據課程的要求,提出對實驗設備的需求,由中心進行安排、配合。